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亍寞金蟲 (小有名氣)
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[求助]
求解GAMESS為啥這么慢。。。
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換組之后新組都是gamess于是入鄉(xiāng)隨俗。。。之前無數(shù)次的聽說gamess效率要比gaussian高，但是隨便計(jì)算的東西，200基函數(shù)左右，B3LYP，6核，gaussian半個(gè)小時(shí)不到連opt帶freq全出來了，gamess光opt就要3小時(shí)，而且還沒優(yōu)化出來。。。而且GAMESS下DFT的HESSIAN說是只有數(shù)值法，隨便測(cè)試了一下子。。。那個(gè)速度反差更大。。。 g09就是網(wǎng)上下載的包，解壓縮寫bashrc直接用 GAMESS是比較新的版本，編譯語言ifort 11.1 +mkl 11.1，并行用sockets 輸入的命令： gaussian %nproc=6 %mem=2500Mb #p opt freq b3lyp/6-31+g(d) scrf=(PCM,solvent=water) GAMESS： $BASIS GBASIS=N31 NGAUSS=6 NDFUNC=1 DIFFSP=.TRUE. $END $CONTRL SCFTYP=RHF RUNTYP=OPTIMIZE DFTTYP=B3LYP MAXIT=100 ICHARG=-1 MULT=1 $END $STATPT NSTEP=20 $END $SYSTEM MWORDS=750 $END $PCM SOLVNT=WATER $END $DATA 然后gaussian的opt也剛好走了20圈 因?yàn)槁犝fgaussian的PCM模型不夠好（？）而且需要在gamess里面自己寫模塊進(jìn)去，所以還是偏向于gamess。。。 請(qǐng)問咱的這個(gè)gamess的輸入里面，只寫必要的命令其他全部default是不是會(huì)有問題呢？這個(gè)計(jì)算速度的問題應(yīng)該怎么解決？還是說無法解決？ 十分感謝！�。� |
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DFT計(jì)算還是Gaussian快；HF，post-HF應(yīng)該是Gamess-US快 sockets比impi編譯的要慢些，Gamess-US跨節(jié)點(diǎn)并行效率比Gaussian好 |
2樓2013-06-27 09:28:22
亍寞
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亍寞
4樓2013-06-27 10:01:18
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