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菌株鑒定---惶恐!真菌的18srRNA在NCBI上blast結(jié)果
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兩段序列如下,我用TBLASTX和BLASTN, 選擇refseq_rna庫,結(jié)果都是跟一種細(xì)菌同源性最高;我后來又用了BLASTN,nr庫,最高的是葉綠體DNA;不知道是我比對(duì)的問題,還是序列的問題,還是染菌了,不懂,求解!!! >rRNA_05 AGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAAC GGTAACAGGAAGCAGCTTGCTGCTTCGCTGACGAGTGGCGGACGGGTGAGTAATGTCTGG GAAACTGCCTGATGGAGGGGGATAACTACTGGAAACGGTAGCTAATACCGCATAACGTCG CAAGACCAAAGAGGGGGACCTTCGGGCCTCTTGCCATCGGATGTGCCCAGATGGGATTAG CTAGTAGGTGGGGTAACGGCTCACCTAGGCGACGATCCCTAGCTGGTCTGAGAGGATGAC CAGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATAT TGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGCCTTCGGGTT GTAAAGTACTTTCAGCGGGGAGGAAGGGAGTAAAGTTAATACCTTTGCTCATTGACGTTA CCCGCAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAA GCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGCAGGCGGTTTGTTAAGTCAGATGTGA AATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTGCATCTGATACTGGCAAGCTTGAGTCTCGTAGAGG GGGGTAGAATTCCAGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATCTGGAGGAATACCGGTGGCG AAGGCGGCCCCCTGGACGAAGACTGACGCTCNAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCC GTAAACGATGTCGACTTGGAGGTTGTGCCCTTGAGGCGTGGCTTCCGGAGCTAACGCGTT AAGTCGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATNNNNNNNNNNNNNGT GAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGC AACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTG CCAGTGATAAACTGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGACCAG GGCTACACACGTGCTACAATGGCGCATACAAAGAGAAGCGACCTCGCGAGAGCAAGCGGA CCTCATAAAGTGCGTCGTAGTCCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTCGGAA TCGCTAGTAATCGTGGATCAGAATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACC GCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGC >rRNA_06 AGAGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCATGCTTAACACATGCAAGTCGAAC GGGAAGTGGTGTTTCCAGTGGCGAACGGGTGAGTAACGCGTAAGAACCTGCCCTTGGGAG GGGAACAACAACTGGAAACGGTTGCTAATACCCCGTAGGCTGAGGAGCAAAAGGAGAAAT CCGCCCAAGGAGGGGCTCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATAGCTTACCAAGGC GATGATCAGTAGCTGGTCCGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAG ACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTCCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGGAGCAA TGCCGCGTGGAGGTGGAAGGCCTACGGGTCGTCAACTTCTTTTCTCGGAGAAGAAACAAT GACGGTATCTGAGGAATAAGCATCGGCTAACTCTGTGCCAGCAGCCGCGGTAAGACAGAG GATGCAAGCGTTATCCGGAATGATTGGGCGTAAAGCGTCTGTAGGTGGCTTTTCAAGTCC GCCGTCAAATCCCAGGGCTCAACCCTGGACAGGCGGTGGAAACTACCAAGCTGGAGTACG GTAGGGGCAGAGGGAATTTCCGGTGGAGCGGTGAAATGCATTGAGATCGGAAAGAACACC AACGGCGAAAGCACTCTGCTGGGCCGACACTGACACTGAGAGACGAAAGCTAGGGGAGCA AATGGGATTAGAGACCCCAGTAGTCCTAGCCGTAAACGATGGATACTAGGTGCTGTGCGA CTCGACCCGTGCAGTGCTGTAGCTAACGCGTTAAGTATCCCGCCTGGGGAGTACGTTCGC AAGAATGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAA T |
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