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liujuanzzu銀蟲 (正式寫手)
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[求助]
高分子蛋白質(zhì)之間相互作用，熵焓變問題。求深入討論。 已有3人參與
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我現(xiàn)在在做一個(gè)聚合物，可與小peptides, protein非共價(jià)鍵相結(jié)合。我做了一系列ITC，得出相互作用的相關(guān)熱力學(xué)參數(shù)，如圖。當(dāng)與小分子his6相結(jié)合時(shí)，基本與，配位單體與his6相結(jié)合H變相同。但與蛋白質(zhì)結(jié)合時(shí)，熵焓變化巨大。我的理解可能是因?yàn)闅滏I的形成。我跟一老人討論，他的意思是聚合物在水中時(shí)為無(wú)規(guī)線團(tuán)，相當(dāng)于球狀聚合物于球狀蛋白相結(jié)合，聚合物有一些影響，polymer effect，但說不清楚明白。 可以說聚合物bind protein以后，聚合物受限，每個(gè)鏈段都受限，所以熵降低很大。但如何解釋焓呢？求深入詳細(xì)的解釋。先謝了。 Picture4.png |
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2樓2013-06-27 21:51:21
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【答案】應(yīng)助回帖
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caominone: 金幣+2, 感謝應(yīng)助 2015-07-30 10:42:40
caominone: 金幣+2, 感謝應(yīng)助 2015-07-30 10:42:40
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所有情況下自由能的變化都很接近，所以KD很接近，分子間相互作用的很多過程都有熵焓互補(bǔ)的現(xiàn)象（entropy－enthalpy compensation），這兩個(gè)參數(shù)對(duì)細(xì)微變化都很敏感，所以通常用自由能來(lái)比較更方便。 （以下屬于個(gè)人分析，不一定對(duì)，：隨著蛋白質(zhì)分子量的增加，參與的弱的分子間相互作用增多，因此焓變?cè)黾?（有利因素），而相互作用力越強(qiáng)，相互作用的兩個(gè)組分的自由度喪失越多，因此熵減增多（不利因素）。所以整個(gè)過程是焓驅(qū)動(dòng)，但是熵焓同時(shí)變化，最后表現(xiàn)出的自由能基本不變。） |
8樓2015-07-29 13:13:32
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