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060842新蟲 (初入文壇)
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[求助]
如何用Materials-studio畫金屬有機(jī)配合物，并且測定配位鍵間的夾角 已有1人參與
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Sample Text用MS中skech atom及skech ring鍵畫出金屬有機(jī)配合物（見圖），加氫并且clean后，發(fā)現(xiàn)金屬原子與配位原子間夾角幾乎全為90度，即金屬原子是平面四邊形結(jié)構(gòu)。 但實(shí)際上金屬原子是正四面體結(jié)構(gòu)，四個配體位于四面體的四個頂點(diǎn)，金屬原子位于體心。 問題：1、金屬有機(jī)配合物應(yīng)該怎么畫？ 2、如何測定金屬有機(jī)配合物中螯合角（即圖中所標(biāo)夾角）？ ms.jpg |
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060842
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2樓2013-06-29 23:00:19
stalart
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4樓2013-07-01 23:06:36
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【答案】應(yīng)助回帖
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但實(shí)際上金屬原子是正四面體結(jié)構(gòu)，四個配體位于四面體的四個頂點(diǎn)，金屬原子位于體心。 問題：1、金屬有機(jī)配合物應(yīng)該怎么畫？ 2、如何測定金屬有機(jī)配合物中螯合角（即圖中所標(biāo)夾角）？ 你做出來的結(jié)構(gòu)是平面結(jié)構(gòu)而不是正四面體結(jié)構(gòu)是因?yàn)槌跏冀Y(jié)構(gòu)不合理，所以clean工具后自動弛豫到比較接近的局域能量最小結(jié)構(gòu)。你可以用選擇工具選擇相應(yīng)的基團(tuán)，通過旋轉(zhuǎn)工具，平移工具把初始結(jié)構(gòu)調(diào)整到四面體結(jié)構(gòu)，操作不難，選中你金屬下面兩個有機(jī)體，旋轉(zhuǎn)90度就可以了，之后再進(jìn)行clean,多次操作會得到你的結(jié)構(gòu) 。 角度測量，有專用工具 distance, angle ,torsion 都可以直接測量。 |
5樓2013-07-02 17:24:23
畢文柱
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6樓2013-10-19 09:09:35
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7樓2015-12-08 19:15:34
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