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rorob銅蟲 (初入文壇)
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[求助]
均方回轉(zhuǎn)半徑與根均方回轉(zhuǎn)半徑兩者的定義及區(qū)別，如何計(jì)算
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想通過分子模擬方法計(jì)算高分子鏈的均方回轉(zhuǎn)半徑 set atomss [atomselect top "resname FMA1 MMA2 MMA3 and z<0"] set indexss [$atomss list] set masscenterss [measure center $atomss] foreach i $indexss { lappend atomcenters [measure center [atomselect top "index $i"]] } #puts $atomcenters foreach cccc $atomcenters { #lappend rg0 [veclength2 [vecsub $masscenterss $cccc]] lappend rg0 [expr [veclength2 [vecsub $cccc $masscenterss]]**2] } #puts $rg0 set lengthss [llength $rg0] set amount 0 for {set numm 0} {$numm < $lengthss} {incr numm} { set amount [expr [lindex $rg0 $numm]+$amount] } puts [ $amount/$lengthss] unset rg0 atomcenters numm amount 這是我未整理過的測(cè)試腳本 大概的意思 就是 ：計(jì)算高分子鏈每個(gè)原子的質(zhì)心到整個(gè)鏈段質(zhì)心間的距離的平方，然后加和除以原子數(shù)。得到一個(gè)平均值。我不知道這樣計(jì)算對(duì)不對(duì)，還有沒有可供參考的數(shù)量做比較。 |
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wujinfanghua
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2樓2013-07-02 11:34:02
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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3樓2013-07-02 15:56:28
rorob
銅蟲 (初入文壇)
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4樓2013-07-02 16:26:38
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5樓2013-07-02 16:58:22
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6樓2013-07-02 17:07:39
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