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yfanzxj新蟲 (初入文壇)
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[求助]
請求牛人幫助解答GALAHAD藥效團(tuán)結(jié)果分析問題 已有1人參與
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我在建模過程中得到以下結(jié)果，但是遇上了幾個(gè)問題，請求牛人解答： 1。在MODEL_012中，F(xiàn)EATS值為8，為什么我在sybyl中看模型時(shí)，只看到7個(gè)藥效團(tuán)？藥效團(tuán)數(shù)量數(shù)量只和N_HITS的值一致？ 2。HBOND值的解釋，bookshelf中只有一句話，The pharmacophoric concordance，這值是越大越好還是越小越好？ GALAHAD結(jié)果分析.jpg |
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jine914
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 16
- 帖子: 9
- 在線: 2小時(shí)
- 蟲號: 6376228
- 注冊: 2017-04-23
- 專業(yè): 藥物化學(xué)
送紅花一朵 
3樓2017-08-25 10:54:17
xiaoxuancao
銀蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
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- 帖子: 55
- 在線: 25.2小時(shí)
- 蟲號: 2669400
- 注冊: 2013-09-21
- 性別: MM
- 專業(yè): 天然有機(jī)化學(xué)
【答案】應(yīng)助回帖
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好久的帖子了，不知道樓主問題解決了沒，我最近也在用galahad做藥效團(tuán)，結(jié)果里面的FEATS值是指產(chǎn)生的藥效特征的數(shù)量，與N-hits無關(guān)，只看到7個(gè)可能是兩個(gè)特征重合了，可以通過PMA觀察每個(gè)feature，N-hits是指你用來生成藥效團(tuán)的活性化合物的數(shù)量。 HBOND越大越好，5,6,7列值可以用來分析藥效團(tuán)模型，ENERGY越小， STERIC ，HBOND越大，模型越好 |
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2樓2014-06-20 14:29:06
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