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wn壞到剛剛好新蟲 (初入文壇)
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[求助]
有關(guān)生物信息學(xué)
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| 如果reads能夠map到contig上，把相應(yīng)contig挑出來，什么軟件能夠?qū)崿F(xiàn)？或者什么方法？ |
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armand0822
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
137167741: 金幣+2, 小木蟲交流，共同進(jìn)步~~ 2013-07-08 16:24:44
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| 一定要用軟件的話，我習(xí)慣用BioEdit的local blast功能， 在彈出來的NCBI Local BLAST參數(shù)設(shè)置界面復(fù)選tabular output；map的結(jié)果會(huì)顯示contig的名稱。你做的是植物，本地?cái)?shù)據(jù)庫(kù)占據(jù)的磁盤空間大，用BioEdit運(yùn)行可能會(huì)比較慢�？梢缘脑�，寫個(gè)小腳本吧。 |
2樓2013-07-08 15:40:58
armand0822
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3樓2013-07-08 15:54:05
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