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生物-TJAB

新蟲 (小有名氣)

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[求助] modeller 菜鳥求助

1.圖片中第4和第12行中為什么加3個(gè)"-"。若沒(méi)有對(duì)于Modeller9.11\Advanced-Modeling\ligand中model-multiple-hetero.py腳本就運(yùn)行不了！
2.第8和第16行最后的/..和/--是什么意思。對(duì)于腳本的運(yùn)行也是必需的

2.png

[ Last edited by 生物-TJAB on 2013-7-20 at 19:36 ]

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1樓 2013-07-20 19:30:35

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金蟲 (小有名氣)

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【答案】應(yīng)助回帖

★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
生物-TJAB: 金幣+2 2013-08-21 13:54:01

-表示模板沒(méi)有匹配對(duì)齊的氨基酸，占個(gè)空位，你刪掉的話后面的就全都亂了，要和目標(biāo)蛋白序列對(duì)應(yīng)的；
/表示多個(gè)鏈的分割符
點(diǎn)表示在蛋白質(zhì)后面的配體，按照編號(hào)順序123，可能是水也可能是晶體里的配體。
*表示結(jié)束。

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