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[求助]
【求助】關(guān)于半經(jīng)驗ZINDO方法的輸入命令 已有1人參與
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求問半經(jīng)驗方法ZINDO的輸入命令是怎樣的。想算一個雜多酸結(jié)構(gòu)，作業(yè)交進去就死掉了，請大神幫忙解決問題。這是輸入文件： %chk=4.chk %mem=1gb %nproc=8 # opt=(noeigentest) ZINDO/1 freq Title Card Required -3 1 Mo -1.98520000 -3.29370000 0.52210000 O -0.50430000 -2.32780000 1.89190000 Mo -2.23550000 -0.97650000 2.31650000 Mo 0.91090000 -1.58630000 3.39420000 Mo 1.14590000 -3.76050000 1.71030000 O -3.65440000 -4.12780000 -0.14720000 O -3.35960000 -2.02440000 1.10200000 O -4.06180000 -0.35600000 2.77410000 O 1.96930000 -3.22510000 3.39600000 O 2.47110000 -5.19020000 2.08050000 O 2.06330000 -1.41970000 5.00070000 O -0.26590000 -2.49550000 4.66780000 Mo -1.25710000 -3.52560000 3.33340000 O -2.66740000 -2.23800000 3.75130000 O -2.43090000 -4.42680000 2.05620000 O -0.00340000 -4.92360000 2.78740000 O -1.88630000 -4.70920000 4.77380000 P -0.55550000 -1.24600000 0.48800000 Mo -0.31010000 1.23610000 2.68140000 O -0.46730000 2.78650000 3.88390000 Mo 0.24660000 -3.92000000 -1.31130000 O 0.42390000 -5.47100000 -2.51050000 Mo 2.44190000 -1.72480000 -0.73510000 O 2.06690000 -3.34710000 -1.79590000 O 0.71800000 -0.40750000 -0.41710000 Mo 2.20740000 0.44660000 0.94660000 Mo -0.89610000 1.12700000 -0.21160000 Mo -0.64570000 -1.19140000 -2.00710000 O -0.08450000 -2.83920000 -2.90770000 O 4.22570000 -2.43640000 -1.23430000 O 3.69950000 -0.51740000 0.14040000 O 3.81830000 1.33690000 1.68860000 O 1.51030000 1.80740000 2.19570000 O -1.88220000 0.29270000 -1.68410000 O -1.82690000 -1.24830000 -3.59880000 O -2.23310000 2.51220000 -0.68660000 O 0.13900000 2.15970000 -1.51470000 Mo 1.48860000 0.78670000 -1.85160000 O 2.47110000 1.76750000 -0.47470000 O 2.73090000 -0.64170000 -2.34070000 O 0.37740000 -0.04900000 -3.22540000 O 2.31230000 1.93550000 -3.22020000 O -1.31990000 -4.80120000 -0.53880000 O 1.04910000 -4.96680000 0.15000000 O -0.65740000 2.46530000 1.19990000 O 0.49150000 0.19120000 4.14460000 O -1.89220000 0.49630000 3.56300000 O 0.50790000 -2.49440000 0.01300000 O 0.27570000 -0.34600000 1.67690000 O 2.73870000 -2.90280000 0.85500000 O 2.50680000 -0.75770000 2.51640000 O -2.44820000 0.53180000 0.96500000 O -2.13290000 -2.38690000 -1.29530000 |
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gmy1990: 金幣+3 2013-07-22 00:49:46
gmy1990: 金幣+3 2013-07-22 00:49:46
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有兩個問題。 1，gaussian的zindo沒有Mo元素的參數(shù)。 2，zindo方法是用光譜參數(shù)擬合的，只能用來算平衡構(gòu)型附近的電子激發(fā)能。結(jié)構(gòu)和頻率計算的結(jié)果是無法預知的，因此gaussian禁止用zindo做這種計算。 建議用mopac程序，既有最新的Mo元素參數(shù)，也能做半經(jīng)驗+CI級別的激發(fā)能計算。但是如果做激發(fā)態(tài)優(yōu)化和頻率的話，最好先問問作者能不能做。 http://openmopac.net/manual/features.html#meci |
2樓2013-07-21 22:47:04
3樓2013-07-22 09:35:24
zindo
金蟲 (小有名氣)
- 應助: 10 (幼兒園)
- 金幣: 1700.4
- 紅花: 2
- 帖子: 227
- 在線: 119.9小時
- 蟲號: 47238
- 注冊: 2004-06-05
- 專業(yè): 結(jié)構(gòu)化學
4樓2013-07-24 10:18:45
【答案】應助回帖
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我想問一下 用ZINDO計算物質(zhì)的吸收光譜 考慮溶劑效應 如何寫程序 輸入文件： %chk=A44tdCCl4 # zindo=(singlets,nstates=20,direct) SCRF=(PCM,READ,Solvent=CCl4) test A44 0 1 6 0 1.364338 -0.063497 -0.000145 6 0 1.738460 -1.422772 0.000222 6 0 3.135061 -1.485502 0.000210 6 0 3.606980 -0.175021 -0.000277 7 0 2.555082 0.681249 -0.000519 1 0 1.028947 -2.235721 0.000495 1 0 3.748953 -2.374535 0.000425 1 0 4.621149 0.199623 -0.000492 6 0 -1.173784 0.088505 0.000203 6 0 -1.666460 -1.294728 0.000817 6 0 2.672262 2.132326 -0.000632 1 0 3.730487 2.395105 -0.002318 1 0 2.207739 2.564809 -0.891564 1 0 2.210457 2.564837 0.891718 6 0 0.107004 0.586807 -0.000126 1 0 0.158880 1.674296 -0.000389 6 0 -2.383461 0.884516 0.000209 7 0 -3.458513 0.156431 -0.000102 8 0 -3.043419 -1.210607 -0.000194 8 0 -1.109854 -2.376105 0.000285 6 0 -2.496344 2.376208 0.000306 1 0 -2.016506 2.807365 0.885746 1 0 -2.015388 2.807582 -0.884417 1 0 -3.548854 2.665522 -0.000312 ALPHA=1.21 TSARE=0.4 輸出錯誤： No SCRF with semi-empirical or MM. Error termination via Lnk1e in d:\g03\l1.exe at Mon Sep 15 16:35:22 2014. Job cpu time: 0 days 0 hours 0 minutes 0.0 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 7 Int= 0 D2E= 0 Chk= 1 Scr= 1 |
5樓2014-09-15 16:58:50
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