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seamas_gao1銀蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
怎樣將SRA文件轉(zhuǎn)化為Fastq文件？求詳細(xì)步驟
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小弟對(duì)語(yǔ)言命令不是太熟。從NCBI上下載SRA文件，經(jīng)搜索需用fastq-dump轉(zhuǎn)化為Fastq文件，但網(wǎng)上好幾中版本都不能用。小弟的電腦是win7 64位，下載sratoolkit.2.3.2-5-win64后打開(kāi)開(kāi)始菜單中的命令提示符，然后輸入網(wǎng)上所說(shuō)的命令，可是不管用。希望有好心人都幫幫忙，感謝！ 總是出現(xiàn)錯(cuò)誤提示：fastq-dump.2.3.2 err: name not found while resolving tree within virtual file system module - failed to open "SRR060731.sra" Written 0 spote total [ Last edited by seamas_gao1 on 2013-8-6 at 15:13 ] |
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下載的SRA數(shù)據(jù)，如何自己用？轉(zhuǎn)換成fasta格式呢？
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