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[求助] error when running pw.x

Subspace diagonalization in iterative solution of the eigenvalue problem:
   a serial algorithm will be used

   Parallelization info
   --------------------
   sticks: dense  smooth    PW    G-vecs: dense smooth    PW
   Min          0    0    0                   0       0    0
   Max          1    1    1                   5       5    5
   Sum          1    1    1                   5       5    5

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
   Error in routine allocate_fft (1):
   wrong ngm
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

   stopping ...

不知道問題在哪  錯(cuò)誤不明確
QE 新手求教

在LOG FILE 中，
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 0) - process 4
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 0) - process 1
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 0) - process 3
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 0) - process 2
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 0) - process 6
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 0) - process 7
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 0) - process 5
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 0) - process 1

多謝�。�！

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1樓 2013-08-16 05:46:41

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編譯完后測(cè)試了沒有？
把輸入文件貼上來看看。

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2樓2013-08-16 14:38:47

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編譯沒問題

# self-consistent calculation
#
cat > alas.scf.in << EOF
&control
calculation='scf'
restart_mode='from_scratch',
tstress = .true.
tprnfor = .true.
prefix='alas',
pseudo_dir = '/home/x_weisu/noback/weiwei/yunguo/raman/mos',
outdir='/home/x_weisu/noback/weiwei/yunguo/raman/mos'
/
&system
nosym = .false.,
ibrav=  4, celldm(1)=0.23372 ,celldm(3) =5.03366, nat=  3, ntyp= 2,
ecutwfc = 37
occupations='smearing',
smearing='mp'
degauss=0.00367
/
&electrons
conv_thr =  1.0d-8
mixing_beta = 0.7
/
ATOMIC_SPECIES
  S 32.06  S.pbe-n-rrkjus_psl.0.1.UPF
  Mo  95.96  Mo.pbe-spn-rrkjus_psl.0.2.UPF
ATOMIC_POSITIONS
S  0.9999999933631344  0.0000000035897103  0.4023766108613526
S  0.9999999964301295  0.0000000066521953  0.5976233891367776
Mo 0.6666666768734000  0.3333333230914300  0.5000000000018697
K_POINTS {automatic}
6 6 1 0 0 0
EOF

mpprun /software/testing/espresso/5.0.2/build01/bin/pw.x < alas.scf.in > alas.scf.out

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3樓2013-08-16 18:14:35

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

原來是要計(jì)算二硫化鉬，那就好辦多了。

這一行：
“ ibrav= 4, celldm(1)=0.23372 ,celldm(3) =5.03366, nat= 3, ntyp= 2,”

二硫化鉬晶格長(zhǎng)度大概是3.16 angstrom，換算成bohr大概是5.97，你的celldm(1)錯(cuò)了。

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4樓2013-08-16 18:59:16

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【答案】應(yīng)助回帖

★ ★ ★ ★ ★
provels: 金幣+5 2013-08-16 20:54:10

還有“ATOMIC_POSITIONS”改成"ATOMIC_POSITIONS {crystal}"。
ATOMIC_POSITIONS后面是有選項(xiàng)的，默認(rèn)的是alat，這個(gè)選項(xiàng)對(duì)應(yīng)直角坐標(biāo)而不是分?jǐn)?shù)坐標(biāo)。

算二硫化鉬要加展寬？我記得不加展寬也能收斂。

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5樓2013-08-16 19:03:54

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引用回帖:

4樓: Originally posted by liqizuiyang at 2013-08-16 18:59:16
原來是要計(jì)算二硫化鉬，那就好辦多了。

這一行：
“ ibrav= 4, celldm(1)=0.23372 ,celldm(3) =5.03366, nat= 3, ntyp= 2,”

二硫化鉬晶格長(zhǎng)度大概是3.16 angstrom，換算成bohr大概是5.97，你的celldm(1)錯(cuò) ...

幫我看看哪有問題？？？

phonon at Gamma point

####
phonons of AlAs at Gamma
&inputph
  tr2_ph=1.0d-12,
  prefix='alas',
  trans=.true.,
  epsil=.true.,
  lraman=.true.,
  elop=.true.,
  amass(1)=32.06,
  amass(2)=95.96,
  outdir='./',
  fildyn='alas.dynG',
  fildrho='alas.drho',
/
0.0 0.0 0.0
###########

多謝�。。�

log file:
_________________________________________________________
Parallelization info
   --------------------
   sticks: dense  smooth    PW    G-vecs: dense smooth    PW
   Min       22    22    7                1782    1782    309
   Max       23    23    8                1799    1799    318
   Sum       367    367 121             28719 28719 5021

   Check: negative/imaginary core charge= -0.000014 0.000000

   negative rho (up, down):  0.119E-02 0.000E+00

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

   Error in routine phq_readin (1):

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

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6樓2013-08-16 21:13:11

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引用回帖:

6樓: Originally posted by provels at 2013-08-16 21:13:11
幫我看看哪有問題？？？

phonon at Gamma point

####
phonons of AlAs at Gamma
&inputph
  tr2_ph=1.0d-12,
  prefix='alas',
  trans=.true.,
  epsil=.true.,
  lraman=.true.,
  elop=.tru ...

不好意思，我沒算過聲子譜，所以不知道哪里出了問題。

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7樓2013-08-16 23:19:53

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看起來你的輸入文件是用QE中附帶的例子改的。

輸入文件最好自己手寫，因?yàn)楦囊延械妮斎胛募y保不會(huì)出現(xiàn)忘記修改某個(gè)參數(shù)的情況。可能算聲子譜時(shí)出錯(cuò)是由文件名出錯(cuò)導(dǎo)致的。

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8樓2013-08-17 09:17:50

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