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Greengenes database的使用
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有沒有人用過這個16s rRNA的數據庫呀？文獻中是這么說的： A representative genomic 16S rRNA gene sequence of A. mobile NGAT was compared using NCBI BLAST [5,6] under default settings (e.g., considering only the high-scoring segment pairs (HSPs) from the best 250 hits) with the most recent release of the Greengenes database [7] and the relative frequen- cies of taxa and keywords (reduced to their stem [8]) were determined, weighted by BLAST scores. 完全不知道怎么操作~求指點~謝謝~  |
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