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lengxue_lc新蟲 (小有名氣)
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[求助]
THz光譜計(jì)算求助
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請(qǐng)問下,做吸收光譜時(shí)候(比如簡單的vitaminC),method怎么設(shè)置的啊?如何得到吸收譜圖,還有opt和Freg用的基組必須一樣嘛?opt時(shí)需要用到TDDFT不?如下圖,如何得到理論的absorbtion譜呢 11.jpg [ Last edited by zhou2009 on 2013-8-30 at 09:28 ] |
經(jīng)驗(yàn) |
木蟲 (著名寫手)
瞌睡木蟲

木蟲 (著名寫手)
瞌睡木蟲
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看你給出的圖,你是要模擬THz光譜; THz光譜是基態(tài)振動(dòng)光譜,因此你只需要計(jì)算opt freq就行了,不需要用到算電子激發(fā)態(tài)的TDDFT; 關(guān)于opt和freq用的基組是否需要相同,回答是必須相同。如果你用GaussView做設(shè)置,在Job Type中直接選擇opt+freq就好,后面的Method中選擇你要選擇的方法和基組。 計(jì)算之后出來的輸出文件,用GaussView打開,在Results菜單中選擇Vibrations,然后在出來的窗口中選擇Spectrum,在出來的圖譜上用單擊鼠標(biāo)右鍵會(huì)出現(xiàn)一個(gè)菜單,選擇Properties,又出來一個(gè)設(shè)置窗口,在X-axis項(xiàng)目的unit處的下拉菜單選擇THz就能得到你想要的THz光譜。 如果橫坐標(biāo)范圍太大,你可以用鼠標(biāo)左鍵在譜圖中畫一個(gè)合適的方框,就能得到范圍大致合適的光譜。 模擬THz光譜需要設(shè)想所有可能的結(jié)構(gòu)(包括可能的分子組成和每種組成下所有結(jié)構(gòu)異構(gòu)體及構(gòu)象異構(gòu)體等),然后找出能量最低的一個(gè)或者幾個(gè),通過綜合考慮來模擬才能與實(shí)驗(yàn)譜取得較好吻合。另外DFT方法需要選擇就有長程相互作用的,基組需要用到較完備的基組,比如最低要求是6-311++G(d,p)。 你給出來的這個(gè)例子中的理論模擬譜與實(shí)驗(yàn)譜的差別就太大了。可以說模擬的很失。 |

木蟲 (著名寫手)
瞌睡木蟲

新蟲 (小有名氣)
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