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sdf從2d轉(zhuǎn)成3d坐標(biāo)中的bond block會(huì)發(fā)生變化嗎 已有1人參與
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請(qǐng)教問題如上，我用兩種方法把sdf文件從2d轉(zhuǎn)成3d后發(fā)現(xiàn)坐標(biāo)發(fā)生變化： 第一種：把sdf文件用marvin打開加氫以后轉(zhuǎn)成3d的 第三種：直接從2d轉(zhuǎn)成3d 這兩種方法所得到的結(jié)果Atom block一致，但是bond blocd有所變化，不知道是什么原因，現(xiàn)在也不知道哪種方法是對(duì)的。 ps：第一種方法2d和3d的bond block一樣，請(qǐng)大俠幫幫我吧，謝謝謝謝，我剛接觸，了解的不多  |
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2樓2013-08-30 21:36:02
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你不能不參考這個(gè)網(wǎng)址幫我分析一下？http://en.wikipedia.org/wiki/Chemical_table_file#Molfile這里面的坐標(biāo)中第三列都是0，這個(gè)是平面的意思嗎？謝謝 |
3樓2013-08-31 10:27:16
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苯環(huán)本來就是平面結(jié)構(gòu)啊，z坐標(biāo)就應(yīng)該是零 4樓2013-08-31 12:13:38
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