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1075460936銅蟲(chóng) (小有名氣)
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Sample Text 各位大神，小弟有個(gè)關(guān)于高斯計(jì)算中優(yōu)化離子型分子的問(wèn)題。在此以氯化銨的分子結(jié)構(gòu)優(yōu)化為例，在gview中畫(huà)出銨離子和氯離子后，提交高斯運(yùn)算時(shí)需要用fragment來(lái)定義分子片段銨離子的電荷+1和氯離子-1嗎，還是直接提交計(jì)算就行了？?jī)煞N計(jì)算結(jié)果在gview中查看電荷分布是一樣的。直接提交計(jì)算會(huì)不會(huì)把離子當(dāng)成自由基來(lái)計(jì)算？在高斯說(shuō)明書(shū)上沒(méi)看懂fragment的含義  。跪求解答。。。 |
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【答案】應(yīng)助回帖
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氯化銨的計(jì)算，本不必作為分子片來(lái)計(jì)算的。這時(shí)是無(wú)溫度、氣相的情形。這時(shí)它只是個(gè)極性分子，象你現(xiàn)在計(jì)算的那樣。 銨離子和氯離子的概念，是在水中的，形成銨水合離子和氯水合離子。 優(yōu)化離子型分子要小心，要看是否可以忽略掉溶劑水的計(jì)算（顯式或隱式），不要把忽略水存在的計(jì)算，當(dāng)成想像中的有水的離子情形。 純分子計(jì)算出的性質(zhì)是分子的內(nèi)因，水是外因，外因通過(guò)內(nèi)因起作用。起作用到什么程度，是否影響到你所觀察到的分子性質(zhì)，決定你是否需要考慮溶劑水的計(jì)算�？紤]溶劑水的計(jì)算難度較大。 |
2樓2013-09-08 14:14:34
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3樓2013-09-09 09:29:45
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4樓2013-09-09 10:01:30
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謝謝您，不好意思，還有個(gè)問(wèn)題，就是關(guān)于gview中畫(huà)這種分子，gview中是不分離子，自由基的吧，需要在gauss輸入文件中寫(xiě)出電荷，但是這種包含正負(fù)離子的分子本身是0電荷的，輸入文件就是0,1，如何保證gauss是按照離子還是自由基計(jì)算的呢，正負(fù)離子的電荷要如何表示在輸入文件中呢？（以氯化銨為例） # opt hf/3-21g geom=connectivity Title Card Required 0 1 Cl -3.83720934 -0.20930232 0.00000000 N -0.11627907 0.02325581 0.00000000 H 0.21704252 -0.91955738 0.00000000 H 0.21706013 0.49465618 0.81649658 H 0.21706013 0.49465618 -0.81649658 H -1.11627907 0.02326826 -0.00000000 是否是這樣的呢？ 不好意思，麻煩您了！ |
5樓2013-09-09 10:50:57
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6樓2013-09-09 11:11:50
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7樓2013-09-09 11:47:38
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