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myapple1989鐵蟲 (小有名氣)
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[求助]
參照菌株如何查找
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| 發(fā)現(xiàn)一株疑似新的放線菌菌種，現(xiàn)在需要做DNA雜交，不知道怎樣獲取參照菌株，現(xiàn)在急用，望大神給予指導(dǎo)，謝謝 |
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9樓2013-09-11 17:04:13
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3樓2013-09-09 15:37:00
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相似度比較低是首要問題。 1、16S序列PCR質(zhì)量如何？ 2、16S序列的測序質(zhì)量又如何？ 3、比對質(zhì)量如何？但愿你沒有比錯數(shù)據(jù)庫，細(xì)菌16S，NCBI有的。 http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=6335505&authorid=2535241 有介紹的比較詳細(xì)。 如果所有以上均沒有問題，那才應(yīng)該走到下一步找親緣的參照菌株做生理生化實(shí)驗(yàn)。 |
4樓2013-09-09 17:08:41
myapple1989
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5樓2013-09-09 18:07:48
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6樓2013-09-11 11:41:51
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7樓2013-09-11 13:30:55
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
myapple1989: 金幣+10, ★★★很有幫助, 謝謝 2013-09-11 18:26:17
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模式菌株的編號前面會有相應(yīng)保藏中心的縮寫，常見的國外的菌種保藏機(jī)構(gòu)有以下幾個： 美國典型微生物菌種保藏中心（ATCC） 美國農(nóng)業(yè)研究菌種保藏中心（NRRL） 德國微生物菌種保藏中心（DSMZ） 荷蘭微生物菌種保藏中心（CBS） 英國微生物菌種保藏中心（NCTC） 日本技術(shù)評價研究所生物資源中心（NBRC） 原則上講，從國外（如ATCC）引進(jìn)新菌株，需要通過國家機(jī)構(gòu)。 其實(shí)直接購買即可，就是進(jìn)關(guān)報(bào)關(guān)比較麻煩。 |
8樓2013-09-11 16:39:36
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10樓2013-09-11 18:29:26
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