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mouwat鐵蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
The eigenvector number1 has zero norm
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在計(jì)算graphene時(shí) 不知道為何會(huì)在這一部分算不過(guò)去 由於我是由單層BN的input改寫(xiě)的 應(yīng)該只需要變更lattice constant吧 但卻出現(xiàn)了虛數(shù)無(wú)法計(jì)算的部分 可以請(qǐng)問(wèn)是哪裡出問(wèn)題了呢 para.err為 0: 0: fxphas_seq.F90:137:ERROR 0: fxphas_seq: 0: The eigenvector number1 has zero norm. tnlo_2.in檔如下 #Definition of lattice parameters #******************************** acell 4.6686384981 4.6686384981 30 rprim 1 0 0 -0.5 0.8660254038 0.0 0 0 1 #Definition of atomic positions and types #************************************* natom 2 ntypat 1 znucl 6 typat 1 1 xred 0.33333 0.66667 0.5 0.66667 0.33333 0.5 ixc 7 #Parameters of the SCF cycles #**************************** iscf 7 nstep 200 #Plane wave basis and k-point grid #********************************* ecut 50 # ecutsm 0.5 dilatmx 1.05 ngkpt 12 12 2 nshiftk 1 shiftk 0.0 0.0 0.5 ndtset 5 jdtset 1 2 3 4 5 #DATASET1 : scf calculation: GS WF in the BZ #******************************************** prtden1 1 kptopt1 1 toldfe1 1.0d-12 #DATASET2 : non scf calculation: GS WF in the whole BZ #***************************************************** getden2 1 kptopt2 2 iscf2 -2 getwfk2 1 tolwfr2 1.0d-22 nband2 4 #DATASET3 : ddk on the MP grid of k-points #***************************************** getwfk3 2 rfdir3 1 1 1 rfelfd3 2 tolwfr3 1.0d-22 nband3 4 kptopt3 2 #DATASET4 : ddE on the MP grid of k-points #***************************************** prtden4 1 getwfk4 2 getddk4 3 rfdir4 1 1 1 rfphon4 1 rfatpol4 1 2 tolvrs4 1.0d-12 rfelfd4 3 nband4 4 kptopt4 2 prepanl4 1 #DATASET5 : 3DTE calculation #*************************** getden5 1 get1den5 4 getwfk5 2 get1wf5 4 nband5 4 kptopt5 2 optdriver5 5 rf1elfd5 1 rf1phon5 1 rf1atpol5 1 2 rf1dir5 1 1 1 rf2elfd5 1 rf2dir5 1 1 1 rf3elfd5 1 rf3dir5 1 1 1 nbdbuf 0 |
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souledge
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2樓2013-09-18 11:31:30
mouwat
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DATASET 4 計(jì)算開(kāi)始會(huì)NAN 我附上了output檔 感謝你的回應(yīng) |
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2013-09-18 14:11:02, 332.38 K
3樓2013-09-18 14:12:20
souledge
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franch: 金幣+2, 謝謝回帖交流 2013-09-23 20:44:08
franch: 金幣+2, 謝謝回帖交流 2013-09-23 20:44:08
 嘗試多次，附件下載不下來(lái)～LZ的DataSet 1有沒(méi)有很好的收斂？我測(cè)試了一下樓主的input，發(fā)現(xiàn)DataSet 1的時(shí)候就非常難以收斂。 仔細(xì)觀察了一下LZ的input，發(fā)現(xiàn)至少有兩處不妥。 1，對(duì)于xred的有效數(shù)字問(wèn)題。為了更有效準(zhǔn)確地找到對(duì)稱性，Abinit一般要求至少10位有效數(shù)字，而LZ明顯只給了6位。比較簡(jiǎn)單的解決方法顯然是寫(xiě)為分?jǐn)?shù)： xred 1/3 2/3 1/2 2/3 1/3 1/2； 2，對(duì)于Graphene類的東西，由于是模擬2D的物質(zhì)，所以k點(diǎn)在z方向上為1，也即：ngkpt 12 12 1。 經(jīng)過(guò)此改動(dòng)后，DataSet 1和DataSet 2的收斂是沒(méi)有問(wèn)題了。 但是DataSet 3的收斂還是有問(wèn)題的(準(zhǔn)確說(shuō)就是無(wú)法收斂)，現(xiàn)在在嘗試解決RF的收斂問(wèn)題。 如果DataSet 3無(wú)法有效收斂，在達(dá)到額定步數(shù)后，程序依然會(huì)認(rèn)為計(jì)算完成，并把結(jié)果用于下一步的計(jì)算，自然在DataSet 4會(huì)出現(xiàn)NaN～ |
4樓2013-09-22 23:50:39
mouwat
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5樓2013-09-23 10:17:40
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6樓2013-09-23 10:45:03
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