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北京石油化工學(xué)院2026年研究生招生接收調(diào)劑公告

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菲常亦可

新蟲 (小有名氣)

應(yīng)助: 0 (幼兒園)
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專業(yè): 合成藥物化學(xué)

[求助] 關(guān)于薛定諤軟件對接結(jié)果保存問題

新人學(xué)用薛定諤做分子對接，首先收集到的分子用ligprep優(yōu)化，然后蛋白質(zhì)形成格點，對接。對接結(jié)果中一個分子有很多個對接打分，但是我只想保留打分最低的一個，應(yīng)該怎么操作呢？因為后期數(shù)據(jù)處理復(fù)雜，所以將結(jié)果導(dǎo)出來手動刪除不現(xiàn)實啊

回復(fù)此樓

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1樓 2013-09-29 10:47:53

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lccbat

金蟲 (初入文壇)

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專業(yè): 理論和計算化學(xué)

【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

ligprep會對每一個分子產(chǎn)生多個構(gòu)象，glide會認(rèn)為這是不同的分子，可以寫一個小程序提取最優(yōu)構(gòu)象。

或者，在ligprep中不生成多個構(gòu)象，在glide中設(shè)定每一個分子只輸出一個結(jié)果，這樣，每個分子就只有一個最優(yōu)結(jié)果了。

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