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關(guān)于新分子gaussian輸入文件、對(duì)稱性、分子最小能量構(gòu)型之間的矛盾
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壇子里的各位大蟲,本人最近在學(xué)習(xí)gaussian09,有幾個(gè)問(wèn)題:1.如果我想優(yōu)化一個(gè)文獻(xiàn)未報(bào)到的分子的結(jié)構(gòu),也就是說(shuō)關(guān)于他的資料信息比較少,對(duì)于它的對(duì)稱性點(diǎn)群信息和最優(yōu)構(gòu)型都未知的情況下,在建立輸入文件的時(shí)候,還用考慮對(duì)稱性限制么?(一個(gè)P原子連接三個(gè)相同基團(tuán)) 2.如果對(duì)一個(gè)未知分子,如果設(shè)置對(duì)稱性限制,讓他屬于某一點(diǎn)群,如果初始結(jié)構(gòu)這樣設(shè)置,那么優(yōu)化出來(lái)的結(jié)構(gòu)不也有對(duì)稱性么,點(diǎn)群應(yīng)該不變的是吧?但是這樣一來(lái),這種有對(duì)稱性的結(jié)構(gòu)一定是最優(yōu)的結(jié)構(gòu)么,會(huì)不會(huì)出現(xiàn),如果一開始不設(shè)置對(duì)稱性限制,那么優(yōu)化出來(lái)的結(jié)構(gòu)反而能量更低,結(jié)構(gòu)更優(yōu)?有對(duì)稱性的分子一定能量最低? |
木蟲 (著名寫手)
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優(yōu)化之前一定要有對(duì)這個(gè)分子一定了解。 能量最低的結(jié)構(gòu)不一定有最高的對(duì)稱性,比如水,還有氨分子,都不具有分子可以具有的最高對(duì)稱性,而只是攜帶一個(gè)子群。 即使不限制對(duì)稱性,也要至少對(duì)分子的結(jié)構(gòu)有一定預(yù)期才行。即使都是不限制對(duì)稱性,從不同的幾何開始優(yōu)化也能得到不同的局部極小 |
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