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張牧童新蟲 (正式寫手)
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[求助]
能量最小化后體系結(jié)構(gòu)出錯(cuò)，有圖求真相！
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大家好，本人在做涂層界面方面的模擬，基底為碳化鎢，即WC，涂層為金剛石，選用的混合勢(shì)，先對(duì)體系能量最小化，然后準(zhǔn)備施加拉伸載荷，模擬其界面強(qiáng)度。但能量最小化過程就出現(xiàn)了問題，發(fā)現(xiàn)能量最小化后，WC的很多W和C穿越了金剛石涂層，得到的體系模型不合常理呀~請(qǐng)問這怎么解釋？前來求助~謝謝大家~ 能量最小化前和能量最小化后模型圖片見附件~ 能量最小化前 能量最小化后 |
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lsloneil
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2樓2013-10-06 00:51:12
張牧童
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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我感覺如果是ppp邊界條件的話出現(xiàn)這樣的情況的話是有可能的，的確是有粒子穿過一側(cè)邊界又從另一側(cè)進(jìn)來了。你能量最小化后的data文件里是不是有image flag？如果有image flag的話，在vmd里用pbc wrap命令可能就可以得到跟開始時(shí)類似的圖像了。 有時(shí)候因?yàn)閐ata文件里image flag的原因，雖然vmd顯示的圖像比較怪異，但并不代表體系有問題。 至于非周期性邊界條件，我猜是不是要在兩側(cè)加兩堵墻把粒子限制住？ |
4樓2013-10-06 11:43:41
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