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風(fēng)吹雪下金蟲 (小有名氣)
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[求助]
關(guān)于PEG的DPD計算
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我在用DPD對PEG進行計算,在劃分珠子時,是應(yīng)該CH2-O-CH2,還是應(yīng)該CH2CH2OH,或者都不對?也就是活潑的基團是應(yīng)該暴露還是不暴露(又如COOR應(yīng)該分為COOH還是COOC)? 進行MD計算F-H=(δi-δj)2*Vij/RT參數(shù)時,密度應(yīng)該采用片段的密度還是PEG的密度?看文獻發(fā)現(xiàn)PEG/H2O的Aij值為0.3,那么這時計算PEG片段與其他片段的Aij值是采用Aij=0.3反推得到的PEG片段的溶解度參數(shù)還是計算得到的溶解度參數(shù),如21?最后,水摩爾體積:如果一個水分子作為一個珠子,摩爾體積為18?5個水分子作為一個珠子,摩爾體積怎么計算?是18*5嗎?文獻中說的是31(Soft Matter, 2012, 8, 375–384 | 375),怎么計算? 問題比較多,謝謝大家 |
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