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金蟲 (小有名氣)

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專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)

[求助] 質(zhì)子化甲醛的NBO解釋

想借助NBO看看孤對(duì)電子離域?qū)щ婋x子的穩(wěn)定作用，得到了質(zhì)子化甲醛的NBO結(jié)果，還是很多地方不明白，請(qǐng)各位指教。
1.HO-CH2+ 和H2C=O+H是一對(duì)共振結(jié)構(gòu)，能否用gaussian分別優(yōu)化得到這兩個(gè)共振結(jié)構(gòu)，目前我只得到了H2C=O+H，這一結(jié)果。
2.如果分析O原子上孤對(duì)電子離域并與C原子形成pi鍵的情況應(yīng)該如何分析呢？
NBO部分結(jié)果如下：
   (Occupancy) Bond orbital/ Coefficients/ Hybrids
---------------------------------------------------------------------------------
   3. (1.99418) BD ( 1) C 1 - O 4
            ( 30.56%) 0.5528* C 1 s( 24.33%)p 3.10( 75.40%)d 0.01(  0.27%)
                                       -0.0001 -0.4858 -0.0852  0.0010 -0.8266
                                          0.0729  0.0072  0.0621 -0.0153 -0.0015
                                       -0.2473 -0.0035  0.0009  0.0020 -0.0247
                                          0.0003 -0.0420  0.0186
            ( 69.44%) 0.8333* O 4 s( 28.22%)p 2.54( 71.68%)d 0.00(  0.10%)
                                          0.0000 -0.5311 -0.0098  0.0000  0.8221
                                       -0.0039 -0.0007 -0.1205 -0.0144  0.0028
                                       -0.1616 -0.0007 -0.0003  0.0165 -0.0006
                                       -0.0019 -0.0200  0.0180
   4. (1.99487) BD ( 2) C 1 - O 4
            ( 22.27%) 0.4720* C 1 s(  5.13%)p18.40( 94.35%)d 0.10(  0.52%)
                                          0.0000 -0.2262 -0.0111 -0.0011 -0.1528
                                          0.0156  0.0009 -0.0049 -0.0108 -0.0019
                                          0.9585  0.0320  0.0017  0.0042  0.0699
                                       -0.0006 -0.0141  0.0103
            ( 77.73%) 0.8816* O 4 s(  0.35%)p99.99( 99.56%)d 0.26(  0.09%)
                                          0.0000 -0.0592 -0.0029  0.0001  0.1579
                                       -0.0001  0.0000  0.0183 -0.0031  0.0002
                                          0.9850  0.0090 -0.0015  0.0024 -0.0212
                                          0.0206 -0.0047 -0.0010
從結(jié)果看C1-O4形成兩個(gè)鍵：BD ( 1) C 1 - O 4 的主要成分是2s和2px
                                          BD ( 2) C 1 - O 4 的主要成分是2pz
是不是可以認(rèn)為BD ( 2) C 1 - O 4（pi鍵）電子主要來源于O原子2pz軌道上的孤對(duì)電子。
3.NHO 這部分應(yīng)該如何解釋呢？
                              Line of Centers       Hybrid 1             Hybrid 2
                              ---------------  ------------------- ------------------
            NBO             Theta Phi Theta Phi Dev Theta Phi Dev
========================================================================================
   1. BD ( 1) C 1 - H 2 77.0  114.5 83.3  112.4 6.6    --    -- --
   2. BD ( 1) C 1 - H 3 81.1  239.2 85.0  239.2 4.0    --    -- --
   3. BD ( 1) C 1 - O 4 86.2  353.6 71.5  356.5  15.0    78.9  170.8  15.1
   4. BD ( 2) C 1 - O 4 86.2  353.6 172.1 7.4  86.1 170.9  185.6  77.4
   5. BD ( 1) O 4 - H 5 95.5 63.9 93.4 63.0 2.3    --    -- --
   8. LP ( 1) O 4          --    --    90.3  299.5 --    --    -- --
4.O4是孤對(duì)電子提供給BD（C1 - O4）鍵電子的供體，二階微擾理論分析中為什么沒有關(guān)于LP（O4）  與 BD（C1 - O4）的作用情況呢  ？

   Threshold for printing: 0.50 kcal/mol
                                                                           E(2)  E(j)-E(i) F(i,j)
      Donor NBO (i)                   Acceptor NBO (j)                kcal/mol a.u. a.u.
===================================================================================================

within unit  1
1. BD ( 1) C 1 - H 2       / 52. BD*( 1) C 1 - O 4          1.89 0.88 0.036
1. BD ( 1) C 1 - H 2       / 53. BD*( 2) C 1 - O 4          1.96 0.51 0.028
1. BD ( 1) C 1 - H 2       / 54. BD*( 1) O 4 - H 5          0.51 1.02 0.020
2. BD ( 1) C 1 - H 3       / 32. RY*( 1) O 4                   0.63 1.79 0.030
2. BD ( 1) C 1 - H 3       / 52. BD*( 1) C 1 - O 4          0.58 0.86 0.020
2. BD ( 1) C 1 - H 3       / 53. BD*( 2) C 1 - O 4          1.81 0.50 0.027
2. BD ( 1) C 1 - H 3       / 54. BD*( 1) O 4 - H 5          1.70 1.01 0.037
3. BD ( 1) C 1 - O 4       / 53. BD*( 2) C 1 - O 4          3.42 0.82 0.047
4. BD ( 2) C 1 - O 4       / 46. RY*( 2) H 5                   1.16 1.95 0.043
4. BD ( 2) C 1 - O 4       / 52. BD*( 1) C 1 - O 4          1.61 0.72 0.030
5. BD ( 1) O 4 - H 5       /  9. RY*( 1) C 1                   3.01 1.85 0.067
5. BD ( 1) O 4 - H 5       / 50. BD*( 1) C 1 - H 2          0.86 1.17 0.028
5. BD ( 1) O 4 - H 5       / 51. BD*( 1) C 1 - H 3          1.10 1.18 0.032
6. CR ( 1) C 1             / 22. RY*( 1) H 2                   0.55 10.73 0.069
6. CR ( 1) C 1             / 24. RY*( 3) H 2                   0.51 12.12 0.070
6. CR ( 1) C 1             / 27. RY*( 1) H 3                   0.73 10.93 0.080
6. CR ( 1) C 1             / 52. BD*( 1) C 1 - O 4          0.81 10.51 0.082
6. CR ( 1) C 1             / 53. BD*( 2) C 1 - O 4          1.98 10.14 0.127
7. CR ( 1) O 4             /  9. RY*( 1) C 1                   1.33 20.10 0.146
7. CR ( 1) O 4             / 11. RY*( 3) C 1                   0.62 20.08 0.099
7. CR ( 1) O 4             / 48. RY*( 4) H 5                   0.84 20.79 0.118
8. LP ( 1) O 4             / 10. RY*( 2) C 1                   1.81 2.76 0.063
8. LP ( 1) O 4             / 45. RY*( 1) H 5                   1.66 2.38 0.056
8. LP ( 1) O 4             / 50. BD*( 1) C 1 - H 2          2.24 1.04 0.043
8. LP ( 1) O 4             / 51. BD*( 1) C 1 - H 3          2.09 1.05 0.042

CH2OH.png

[ Last edited by nnipp on 2013-10-14 at 15:29 ]

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1樓 2013-10-12 17:08:32

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