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關(guān)于GENBANK_ACCESSION轉(zhuǎn)換成為基因名簡(jiǎn)稱 已有1人參與
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關(guān)于GENBANK_ACCESSION轉(zhuǎn)換成為基因名簡(jiǎn)稱： 得到很多關(guān)于GENBANK_ACCESSION.eg:NM_024958 NM_001039140 NM_001012426 NM_006943 NM_001178133 NM_052876 NM_003307 ，..................................由于很多，所以沒辦法一個(gè)個(gè)去查，先轉(zhuǎn)換成基因的簡(jiǎn)寫，eg：PFN2 BTBD1 EID2 ZNF267 GHITM LCOR 請(qǐng)大師支招有沒有什么軟件之類的能大批量轉(zhuǎn)換，或者從基因簡(jiǎn)稱轉(zhuǎn)換成為GENBANK_ACCESSION也可以。謝謝~~~~~~~~~~~ |
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cxzdsa2332
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【答案】應(yīng)助回帖
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david應(yīng)該就能轉(zhuǎn)吧，直接使用復(fù)制黏貼批量拷進(jìn)去一次網(wǎng)頁(yè)上4,5萬(wàn)條id轉(zhuǎn)換應(yīng)該可以吧，如果選擇上傳慢得要死還不如網(wǎng)頁(yè)上直接黏貼；但是相同id轉(zhuǎn)換后貌似會(huì)自動(dòng)刪重復(fù)，好處是比較無(wú)腦 推薦用r，利用org.Hs.eg.db包就能做，數(shù)據(jù)庫(kù)選“ACCNUM”參考這篇文章就行了http://www.bio-info-trainee.com/710.html |
2樓2018-06-29 16:29:56
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