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paladinlee鐵桿木蟲 (正式寫手)
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[求助]
MS中compass力場(chǎng)算TiO2一直出錯(cuò) 已有1人參與
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大家好！以前自己編程算MD，最近剛剛上手MS，用MS的compass力場(chǎng)算TiO2（自己編太麻煩了 ）。模型直接從structure里面導(dǎo)入，沒有問(wèn)題。 然后不管是用discover還是forcite做dynamic計(jì)算的時(shí)候，都不能計(jì)算，一直error。顯示沒有Ti和O鍵的參數(shù)（鍵能，鍵角，二面角等等....） 不僅我的電腦算不了，其他朋友新版本（正版）的MS也算不了。出現(xiàn)一樣的error。 請(qǐng)問(wèn)有人遇到過(guò)這種問(wèn)題嗎？ |
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pigrass
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paladinlee: 金幣+5, ★有幫助, 你說(shuō)的方法我都試過(guò)了，包括assign，我現(xiàn)在的問(wèn)題是bond energy missing！�。∧憧纯茨闼愕臎]問(wèn)題的輸出結(jié)果里有沒有TiO2 bond energy信息 2013-10-30 17:41:23
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
paladinlee: 金幣+5, ★有幫助, 你說(shuō)的方法我都試過(guò)了，包括assign，我現(xiàn)在的問(wèn)題是bond energy missing！�。∧憧纯茨闼愕臎]問(wèn)題的輸出結(jié)果里有沒有TiO2 bond energy信息 2013-10-30 17:41:23
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做了好幾次都是成功的 你把energy選項(xiàng)卡——compass旁邊的more點(diǎn)開來(lái)，勾選calculate automatically就不會(huì)出現(xiàn)下圖的錯(cuò)誤了 |
3樓2013-10-30 01:16:04
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paladinlee: 金幣+10, ★有幫助, 這是一種方法，問(wèn)題是從structure導(dǎo)入的結(jié)構(gòu)有鍵��？ 2013-10-30 17:35:03
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paladinlee: 金幣+10, ★有幫助, 這是一種方法，問(wèn)題是從structure導(dǎo)入的結(jié)構(gòu)有鍵��？ 2013-10-30 17:35:03
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COMPASS是包含TiO2的力場(chǎng)的，出現(xiàn)錯(cuò)誤的原因在于，Ti-O不存在共價(jià)鍵，鍵參數(shù)自然不存在了。 解決辦法：在Discover-Setup的Typing中，先Calculate給所有的原子分配好力場(chǎng)，再在Automation中三個(gè)選項(xiàng)全部選no，最后把Ti與O之間的鍵全部刪除，即可。 |
2樓2013-10-29 19:17:39
月只藍(lán)
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paladinlee: 金幣+20, ★★★很有幫助, Impressive！非常感謝！還有一個(gè)問(wèn)題請(qǐng)教下，我在forcite里按這套路走下去，會(huì)出現(xiàn)體系能量過(guò)大的情況，體系optimized后也一樣。是內(nèi)部算法的問(wèn)題嗎？ 2013-10-31 09:38:26
paladinlee: 金幣+20, ★★★很有幫助, Impressive！非常感謝！還有一個(gè)問(wèn)題請(qǐng)教下，我在forcite里按這套路走下去，會(huì)出現(xiàn)體系能量過(guò)大的情況，體系optimized后也一樣。是內(nèi)部算法的問(wèn)題嗎？ 2013-10-31 09:38:26
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MS-->Help-->Tutorials-->Discover Tutorials-->Forcefied typing in metal oxides 這里面有官方詳細(xì)的說(shuō)明以及操作，看完你就知道原因了。 |
4樓2013-10-30 18:32:06
aa2349439
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5樓2014-04-22 10:42:38
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