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身在長(zhǎng)沙

新蟲(chóng) (初入文壇)

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[求助] NEB的計(jì)算出現(xiàn)負(fù)值，測(cè)試的其他能量都比初始的00和終止的10低

問(wèn)題如下：
1.計(jì)算NEB的方法：首先利用nebmake.pl產(chǎn)生初始終態(tài)結(jié)構(gòu)，用xcrysden查看了路徑?jīng)]問(wèn)題，然后對(duì)初始終態(tài)結(jié)構(gòu)進(jìn)行幾何結(jié)構(gòu)優(yōu)化，接著采用優(yōu)化后的能量構(gòu)型進(jìn)行NEB的計(jì)算，按照VASP manual上說(shuō)明，在INCAR中設(shè)置如下：
ISTART = 0; ICHARG = 2
ENCUT  = 400
ISMEAR = 2
LREAL=Auto
NELM=200
NSW=1000
EDIFFG=-0.02
LWAVE = F
LCHARG = F
ICHAIN=0
IMAGES=9
SPRING=-5
LCLIMB=.TRUE.
IBRION=3
POTIM=0
IOPT=7
算完之后用nebbarrier.pl產(chǎn)生的neb.dat如下：
0    0.000000    0.000000    0.000000 0
  1    0.151183 -2.145471 -0.242258 1
  2    0.302705 -2.106921 -0.362263 2
  3    0.452469 -2.051050 -0.403422 3
  4    0.603020 -2.012050 -0.282203 4
  5    0.753502 -1.992645    0.000084 5
  6    0.904120 -2.012146    0.253874 6
  7    1.054939 -2.051164    0.407455 7
  8    1.204729 -2.107090    0.352265 8
  9    1.356227 -2.145477    0.236853 9
10    1.507559    0.000000    0.000000  10
初末位置的能量我多次驗(yàn)算都是最低的，不知道是什么原因，求大神們不吝指教我這個(gè)新手！謝謝啦

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1樓 2013-11-04 12:04:11

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zjh-111

銀蟲(chóng) (小有名氣)

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【答案】應(yīng)助回帖

引用回帖:

8樓: Originally posted by 身在長(zhǎng)沙 at 2013-11-04 16:49:32
我的計(jì)算腳本都是師兄師姐用過(guò)留下來(lái)的，這讓我怎么搞�。窟€有這個(gè)腳本最新的你知道在哪里下載嗎？麻煩你了...

嗯，我都是自己寫，你可以上官網(wǎng)下個(gè)最新的看看，要么你那個(gè)腳本貼出來(lái)給我看看
一般情況我覺(jué)得問(wèn)題不大，很可能就是把負(fù)號(hào)當(dāng)正號(hào)就行了

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9樓2013-11-04 18:40:42

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liu-biao

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【答案】應(yīng)助回帖

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2樓2013-11-04 12:16:40

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emilyoyang

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【答案】應(yīng)助回帖

★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
identation: 金幣+1, 謝謝交流 2013-11-04 13:53:17

你把03這個(gè)結(jié)構(gòu)拿出來(lái) 做一下結(jié)構(gòu)優(yōu)化，看看是否能夠回到00結(jié)構(gòu)
不能的話，就是你初始結(jié)構(gòu)沒(méi)找對(duì)，也就是說(shuō)沒(méi)有找到能量最低結(jié)構(gòu)

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3樓2013-11-04 12:43:21

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身在長(zhǎng)沙

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引用回帖:

3樓: Originally posted by emilyoyang at 2013-11-04 12:43:21
你把03這個(gè)結(jié)構(gòu)拿出來(lái) 做一下結(jié)構(gòu)優(yōu)化，看看是否能夠回到00結(jié)構(gòu)
不能的話，就是你初始結(jié)構(gòu)沒(méi)找對(duì)，也就是說(shuō)沒(méi)有找到能量最低結(jié)構(gòu)

謝謝你的回復(fù)，這個(gè)我做過(guò)了，弛豫之后又回到00結(jié)構(gòu)了。而且我做到這個(gè)構(gòu)型的能量最低位置與文獻(xiàn)上的是一致的。我懷疑是參數(shù)設(shè)置那里出了問(wèn)題，麻煩你再幫我看看。新手上路，請(qǐng)多多指教�。�

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4樓2013-11-04 13:10:11

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