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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 生物醫(yī)藥區(qū) » 微生物 » 綜合其他 » KEGG Mapper
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[求助]
KEGG Mapper 已有1人參與
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小弟現(xiàn)在在做基因組代謝網絡，現(xiàn)有個問題想請教各位大蟲，就是我把我建立的代謝網絡粗模型（儲存在excel的文件）如何利用KEGG Mapper將其可視化，便于我查找Gap？還有就是excel數(shù)據(jù)如何轉換成SBML語言格式的文件？最好各位具體點說，小弟在此不勝感激，對合適的答案小弟愿意繼續(xù)追加金幣。 [ Last edited by jmcookie on 2013-11-5 at 10:53 ] |
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libranjie
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【答案】應助回帖
★
jmcookie: 金幣+1, ★有幫助, 非常感謝 2013-12-26 19:08:19
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http://www.genome.jp/kegg/tool/map_pathway2.html 如果你輸入了合適的可以識別的ID，例如KO編號，加顏色，將基因組的基因對應的KO編號輸入KEGG就會得到圖片， 其中存在的呈色彩，不通、不存在的用黑色表示。 |
5樓2013-12-26 16:54:32
yechao0911
木蟲 (正式寫手)
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2樓2013-11-29 22:03:09
3樓2013-11-30 08:11:18
yechao0911
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4樓2013-11-30 16:22:35
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