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yuehedou木蟲 (小有名氣)
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[求助]
求教幾個microRNA前體的概念：biased error和biased bulge等的意思
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| 這幾天看關(guān)于使用高通量測序分析植物miRNA的文獻，看到一部分使用mFold預(yù)測miRNA前體的軟件設(shè)置，幾個名詞看不懂了，希望哪位高手賜教一二。原文處是：no more than 8 nucleotides and 4 biased errors in one bulge and no more than 2 biased bulges and 6 errors in mature region of the predicted hairpin. 其中的biased error， biased bulge和mature region的概念不太懂，求賜教！最好還能把這句話給翻譯下。。。 |
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【答案】應(yīng)助回帖
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mature region很好理解 前體就是不成熟的miRNA 成熟的就是最終留下的那幾十個bp的RNA片段 bulge代表dsRNA中的某一條鏈會多出一個或多個不能配對的堿基 導(dǎo)致在這一側(cè)形成一個突起（另一邊不會） error我想應(yīng)該是因為兩側(cè)堿基無法配對而導(dǎo)致internal loop的情況吧 下面這個圖很形象的給出了RNA的各種二級結(jié)構(gòu)： www.nature.com/nrm/journal/v5/n12/fig_tab/nrm1528_F1.html |
2樓2013-11-11 13:04:30
yuehedou
木蟲 (小有名氣)
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3樓2013-11-11 15:16:34
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