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[求助] pwscf的原子坐標(biāo)ATOMIC_POSITIONS設(shè)置

pwscf中輸入原子坐標(biāo)部分，我能直接用ms的*.cell文件中的原子坐標(biāo)嗎？能的話ATOMIC_POSITIONS后面{}我要填什么啊？
之前填的是crystal，但是我用xcrysden導(dǎo)入input文件，出來的結(jié)構(gòu)跟ms里差很多
xcrysden中出現(xiàn)的

ms中建的模型

pwscf的原子坐標(biāo)ATOMIC_POSITIONS設(shè)置-1

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1樓 2013-11-20 22:02:33

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另附input
&system
   ibrav=11
   celldm(1)=8.653,
   celldm(2)=1.157
   celldm(3)=0.655,
   nat=10, ntyp=2
   ecutwfc=60
   ecutrho=720
   occupations='smearing', smearing='methfessel-paxton', degauss=0.03
   la2F =.true.
/
&electrons
   conv_thr= 1.0d-9
   mixing_beta = 0.7
/
ATOMIC_SPECIES
Fe 55.845 Fe.blyp-sp-van.UPF
B  10.811 B.blyp-n-van_ak.UPF
ATOMIC_POSITIONS {crystal}
Fe 0.0000000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000
Fe 0.5000000000000000 0.4999999999999999 0.5000000000000000
  B 0.2486999928951263 0.3122999966144565  -0.0000000000000001
  B  -0.2486999928951263  -0.3122999966144565  -0.0000000000000001
  B 0.2513000071048737 0.8122999966144565 0.5000000000000000
  B 0.7486999928951265 0.1877000033855435 0.5000000000000001
  B 0.3411000072956085 0.1263000071048737 0.4999999999999999
  B  -0.3411000072956085  -0.1263000071048737 0.5000000000000000
  B 0.1588999927043915 0.6263000071048736 0.0000000000000000
  B 0.8411000072956086 0.3736999928951263 0.0000000000000000
K_POINTS {automatic}
16 16 28 0 0 0

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2樓2013-11-20 22:13:31

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dx0620: 金幣+7, ★★★很有幫助 2013-11-25 10:29:02
dx0620: 金幣+3, ★★★很有幫助 2013-11-25 14:32:29

ibrav=11是orthorhombic body centered，因為是體心的，所以導(dǎo)致你做出的結(jié)構(gòu)里面多了好多紅色的原子。貌似你應(yīng)該改用orthorhombic primitive，也就是ibrav=8。另外乍一看去，樓主的ecutwfc取得好像太高，K點也過密。

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3樓2013-11-25 09:34:24

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3樓: Originally posted by superdonnie at 2013-11-25 09:34:24
ibrav=11是orthorhombic body centered，因為是體心的，所以導(dǎo)致你做出的結(jié)構(gòu)里面多了好多紅色的原子。貌似你應(yīng)該改用orthorhombic primitive，也就是ibrav=8。另外乍一看去，樓主的ecutwfc取得好像太高，K點也過密 ...

ecutwfc我大概測試了下，50-60左右，這是第一步加密K點算的，所以比較密。我確定ibrav的時候從materials studio里看行嗎？

pwscf的原子坐標(biāo)ATOMIC_POSITIONS設(shè)置-2

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4樓2013-11-25 10:28:09

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4樓: Originally posted by dx0620 at 2013-11-25 10:28:09
ecutwfc我大概測試了下，50-60左右，這是第一步加密K點算的，所以比較密。我確定ibrav的時候從materials studio里看行嗎？
...

我沒用過materials studio，不曉得是否能從那里面直接看（能不能直接用肯定也取決于你在QE的input里的具體設(shè)置），不過至少可以作為一個參考的。 ibrav具體怎么取還要看具體情況，而且可能性往往不止一種。比如這里你也可以設(shè)置ibrav=0，然后指定crystal lattice vector，或者還可以把你的結(jié)構(gòu)當(dāng)作三斜的，指定a, b, c, alpha, beta, gamma，看個人愛好，以及如何設(shè)置方便。不過不管怎么說，樓主都要對程序里的結(jié)構(gòu)參數(shù)以及要做的體系的實際結(jié)構(gòu)有一個了解，才方便進行設(shè)置的。

關(guān)于ecutwfc，我不知道樓主為什么要加密K點，但我不認為加密K點就需要提高ecutwfc，貌似沒有太大關(guān)系。

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5樓2013-11-25 12:33:03

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5樓: Originally posted by superdonnie at 2013-11-25 12:33:03
我沒用過materials studio，不曉得是否能從那里面直接看（能不能直接用肯定也取決于你在QE的input里的具體設(shè)置），不過至少可以作為一個參考的。 ibrav具體怎么取還要看具體情況，而且可能性往往不止一種。比如這里 ...

我不是說提高ecutwfc是為的加密K點。我的ecutwfc經(jīng)過收斂測試選取的；我是計算電聲耦合，這里截取的input是第一步加密K點的計算

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6樓2013-11-25 14:43:35

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再請問，pwscf中的輸出文件中，能查看所建結(jié)構(gòu)的空間群嗎？
麻煩你了，謝謝~

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7樓2013-11-25 15:14:38

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7樓: Originally posted by dx0620 at 2013-11-25 15:14:38
再請問，pwscf中的輸出文件中，能查看所建結(jié)構(gòu)的空間群嗎？
麻煩你了，謝謝~...

不能的，要用其他的軟件分析查看。

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8樓2013-11-25 18:53:16

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8樓: Originally posted by superdonnie at 2013-11-25 18:53:16
不能的，要用其他的軟件分析查看。...

比如？我現(xiàn)在只知道xcrysden可以導(dǎo)入，但是它貌似也不能看空間群吧

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9樓2013-11-25 19:43:11

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9樓: Originally posted by dx0620 at 2013-11-25 19:43:11
比如？我現(xiàn)在只知道xcrysden可以導(dǎo)入，但是它貌似也不能看空間群吧...

一般的找對稱性的軟件，比如findsym。需要你利用原子坐標(biāo)設(shè)置一個findsym的輸入文件。

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10樓2013-11-25 19:58:08

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