tim562944200

金蟲 (小有名氣)

應(yīng)助: 10 (幼兒園)
金幣: 963.2
帖子: 210
在線: 100.5小時(shí)
蟲號(hào): 2525506

[交流] lammps中change_box命令的使用,無法將模擬體系放在模擬盒子中間位置急求~!

在立方體的盒子中做完弛豫過程后,想在盒子的x方向上向正負(fù)兩個(gè)方向各拉長一個(gè)距離75,使分子體系位于拉長后模擬盒子的中間位置,采用change_box命令
change_box all x delta -75 150 units box
但是完成后分子體系一直位于模擬盒子左端的位置,不能到中間,求高手指導(dǎo)!

jietu.png

回復(fù)此樓

» 猜你喜歡

08工科275分求調(diào)劑已經(jīng)有13人回復(fù)
材料工程322分已經(jīng)有6人回復(fù)
一志愿北京科技大學(xué)085601材料工程英一數(shù)二初試總分335求調(diào)劑已經(jīng)有7人回復(fù)
274求調(diào)劑已經(jīng)有5人回復(fù)
【求調(diào)劑】新能源材料本科，一志愿211，初試321 已經(jīng)有3人回復(fù)
材料考研調(diào)劑已經(jīng)有3人回復(fù)
材料調(diào)劑已經(jīng)有12人回復(fù)
英一數(shù)一408，總分284，二戰(zhàn)真誠求調(diào)劑已經(jīng)有14人回復(fù)
085410 一志愿211 22408分?jǐn)?shù)359求調(diào)劑已經(jīng)有4人回復(fù)
271求調(diào)劑已經(jīng)有19人回復(fù)

» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)

» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:

LAMMPS----compute coord/atom命令已經(jīng)有11人回復(fù)
【討論】lammps中利用velocity命令無法控制住速度問題已經(jīng)有11人回復(fù)
【討論】lammps中關(guān)于fix ave/spatial命令的輸出問題已經(jīng)有4人回復(fù)
【討論】LAMMPS的replicate command與creat box區(qū)別已經(jīng)有3人回復(fù)

» 搶金幣啦！回帖就可以得到:

查看全部散金貼

1樓 2013-11-25 13:01:47

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

回帖支持 ( 顯示支持度最高的前 50 名 )

老虎大王

木蟲 (著名寫手)

★ ★ ★ ★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
月只藍(lán): 金幣+3, 專家考核, 感謝指導(dǎo)！ 2014-02-14 15:09:47

你的命令不是兩邊各移動(dòng)75，按照你的命令，你應(yīng)該是左邊界左移75，右邊界右移150。你可對(duì)照Manual，看看生成的結(jié)果。

這種改變邊界位置的事情，我一般不用這個(gè)命令。你弛豫過后，可以在文件末用write_data命令把構(gòu)型寫入一個(gè)文件，然后手工在文件上改，把xlo和xhi改成任何你要的數(shù)字，而坐標(biāo)不變，然后存起來。然后寫一個(gè)新的輸入文件，用read_data命令把你改過的構(gòu)型文件讀進(jìn)來。這是最保險(xiǎn)的的作法了。也放心也不費(fèi)事。

贊一下(1人)

回復(fù)此樓

3樓2013-11-28 09:39:19

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

tim562944200

金蟲 (小有名氣)

應(yīng)助: 10 (幼兒園)
金幣: 963.2
帖子: 210
在線: 100.5小時(shí)
蟲號(hào): 2525506

引用回帖:

7樓: Originally posted by LoogCat at 2014-07-14 21:21:18
你用的是什么軟件顯示的�。吭趺达@示盒子呢？

VMD顯示的，輸入命令pbc box顯示盒子

贊一下(1人)

回復(fù)此樓

8樓2014-07-16 10:53:57

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

普通回帖

tim562944200

金蟲 (小有名氣)

應(yīng)助: 10 (幼兒園)
金幣: 963.2
帖子: 210
在線: 100.5小時(shí)
蟲號(hào): 2525506

自己已解決

回復(fù)此樓

2樓2013-11-26 08:57:39

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

tim562944200

金蟲 (小有名氣)

應(yīng)助: 10 (幼兒園)
金幣: 963.2
帖子: 210
在線: 100.5小時(shí)
蟲號(hào): 2525506

引用回帖:

3樓: Originally posted by 老虎大王 at 2013-11-28 09:39:19
你的命令不是兩邊各移動(dòng)75，按照你的命令，你應(yīng)該是左邊界左移75，右邊界右移150。你可對(duì)照Manual，看看生成的結(jié)果。

這種改變邊界位置的事情，我一般不用這個(gè)命令。你弛豫過后，可以在文件末用write_data命令把 ...

謝謝回復(fù),我一定會(huì)試一下你的方法,不過我弛豫過后用dis_change命令拉長了方向后接著開始模擬過程,會(huì)出現(xiàn)如下圖片的問題,我個(gè)人理解是弛豫過后有些分子在邊界上不完整造成的,不知道你的方法會(huì)不會(huì)有這樣的問題? 也請(qǐng)教一下這樣的問題如何解決?

lammps中change_box命令的使用,無法將模擬體系放在模擬盒子中間位置急求~!-1

2013-11-28 14:26:08的屏幕截圖.png

贊一下

回復(fù)此樓

4樓2013-11-28 14:32:27

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

jiaoyixiong

榮譽(yù)版主 (職業(yè)作家)

模擬EPI: 6
應(yīng)助: 487 (碩士)
貴賓: 0.501
金幣: 14945
帖子: 3750
在線: 1129.1小時(shí)
蟲號(hào): 1108016

★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖

好簡單啊，把你的模擬體系整體平移一段不久行了。
從你的圖上看，把所有的原子x坐標(biāo)加上大概盒子長度的一半不就到中間了？

贊一下

回復(fù)此樓

5樓2013-11-28 14:57:42

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

tim562944200

金蟲 (小有名氣)

應(yīng)助: 10 (幼兒園)
金幣: 963.2
帖子: 210
在線: 100.5小時(shí)
蟲號(hào): 2525506

引用回帖:

5樓: Originally posted by jiaoyixiong at 2013-11-28 14:57:42
好簡單啊，把你的模擬體系整體平移一段不久行了。
從你的圖上看，把所有的原子x坐標(biāo)加上大概盒子長度的一半不就到中間了？

謝謝已經(jīng)解決了

回復(fù)此樓

6樓2013-11-28 15:07:46

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

LoogCat

鐵蟲 (小有名氣)

應(yīng)助: 3 (幼兒園)
金幣: 148.8
帖子: 111
在線: 18.3小時(shí)
蟲號(hào): 2448730

★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖

你用的是什么軟件顯示的��？怎么顯示盒子呢？

贊一下

回復(fù)此樓

7樓2014-07-14 21:21:18

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

fengliu

鐵桿木蟲 (小有名氣)

應(yīng)助: 0 (幼兒園)
金幣: 5772.5
帖子: 59
在線: 117.8小時(shí)
蟲號(hào): 1209758

★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖

樓主，能否說一下你是怎么解決的嗎？謝謝。

贊一下

回復(fù)此樓

9樓2014-10-31 10:29:16

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

superbuff

新蟲 (初入文壇)

應(yīng)助: 0 (幼兒園)
金幣: 412.8
帖子: 23
在線: 6.1小時(shí)
蟲號(hào): 2654916

★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖

請(qǐng)問樓主，你是怎么解決wrap的問題的

贊一下

回復(fù)此樓

10樓2015-11-04 07:06:44

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

fyz_ok

金蟲 (正式寫手)

應(yīng)助: 11 (小學(xué)生)
金幣: 620.1
帖子: 391
在線: 161.6小時(shí)
蟲號(hào): 288530

★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖

引用回帖:

2樓: Originally posted by tim562944200 at 2013-11-26 08:57:39
自己已解決

請(qǐng)問你是怎么解決的呢？

發(fā)自小木蟲IOS客戶端

贊一下

回復(fù)此樓

11樓2016-09-13 04:54:37

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

最具人氣熱帖推薦 [查看全部]	作者	回/看	最后發(fā)表

[考研] 材料求調(diào)劑 +8	呢呢妮妮 2026-04-01	10/500	2026-04-01 22:24 by salamander`
[考研] 292求調(diào)劑 +17	木蟲er12138 2026-04-01	17/850	2026-04-01 21:37 by 七度不信任
[考研] 286求調(diào)劑 +5	lim0922 2026-03-26	5/250	2026-04-01 19:08 by 客爾美德
[考研] 362求調(diào)劑 +13	西南交材料專碩3 2026-03-31	13/650	2026-04-01 17:38 by JYD2011
[考研] 08工科275求調(diào)劑，可跨考。 +5	AaAa7420 2026-03-31	5/250	2026-04-01 15:21 by 159357hjz
[考研] 291求調(diào)劑 +3	迷蒙木木 2026-04-01	4/200	2026-04-01 11:07 by 逆水乘風(fēng)
[考研] 08工科，295，接受跨專業(yè)調(diào)劑 +6	lmnlzy 2026-03-31	6/300	2026-04-01 11:02 by 逆水乘風(fēng)
[考研] 一志愿：西北大學(xué)，英一數(shù)一408-284分求調(diào)劑 +7	12.27 2026-03-27	7/350	2026-03-31 21:59 by lbsjt
[考研] 299求調(diào)劑 +8	嗯嗯嗯嗯2 2026-03-27	8/400	2026-03-31 18:23 by lizhi8172
[考研] 286求調(diào)劑 +5	丟掉懶惰 2026-03-27	8/400	2026-03-31 11:27 by Delta2012
[考博] 材料專業(yè)申博 +5	杜雨婷dyt 2026-03-29	5/250	2026-03-31 11:19 by oooqiao
[考研] 269求調(diào)劑 +4	我想讀研11 2026-03-31	4/200	2026-03-31 10:04 by cal0306
[考研] 274求調(diào)劑 +6	xiao愛同學(xué) 2026-03-30	6/300	2026-03-31 10:04 by cal0306
[考研] 調(diào)劑 +4	GK72 2026-03-30	4/200	2026-03-30 20:32 by dick_runner
[考研] 291求調(diào)劑 +5	Y-cap 2026-03-29	6/300	2026-03-29 13:18 by mumin1990
[考研] 085600，專業(yè)課化工原理，321分求調(diào)劑 +5	大饞小子 2026-03-28	5/250	2026-03-29 08:56 by qingfeng258
[考研] 求調(diào)劑 +7	爭取九點(diǎn)睡 2026-03-28	8/400	2026-03-28 21:07 by 爭取九點(diǎn)睡
[考研] 295求調(diào)劑 +5	1428151015 2026-03-27	6/300	2026-03-28 04:04 by fmesaito
[考研] 265求調(diào)劑11408 +3	劉小鹿lu 2026-03-27	3/150	2026-03-27 20:53 by nihaoar
[考研] 考研調(diào)劑 +9	小蠟新筆 2026-03-26	9/450	2026-03-27 11:10 by 不吃魚的貓