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周大熊鐵蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
16srRNA序列只能查到載體下游序列，不能查到上游，為什么~》》
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| 為啥呢~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~已經(jīng)反相互補(bǔ)過(guò)，就能查到下游序列 |
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周大熊
鐵蟲(chóng) (小有名氣)
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3樓2013-11-28 13:45:02
michael_sc
新蟲(chóng) (初入文壇)
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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你送測(cè)的樣品是用什么引物p的？ 是做了TA clone之后送的？ 理論上你送測(cè)然后用27f，1492r之類的測(cè)序是沒(méi)辦法找到上下游引物的，因?yàn)闇y(cè)序方法的問(wèn)題，前幾十bp是不能用的。 如果是做了TA clone的話，用質(zhì)粒上引物測(cè)序是肯定能得到上下游引物的。 所以我覺(jué)得幾種可能： 1. 上游引物在測(cè)序的時(shí)候沒(méi)讀好，有一倆個(gè)堿基測(cè)錯(cuò)。 2. 細(xì)菌本身在上游引物位點(diǎn)有一兩個(gè)堿基的突變。 3. 測(cè)序結(jié)果你在拼接的時(shí)候沒(méi)拼好= = |
2樓2013-11-28 12:12:43
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