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Trevor1983鐵桿木蟲 (正式寫手)
探險(xiǎn)家
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高斯優(yōu)化構(gòu)建的小分子，為什么每次優(yōu)化后的坐標(biāo)不完全相同？
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| 寫了一篇小論文，其中涉及用高斯軟件對(duì)小分子進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化，對(duì)一個(gè)碘分子用DFT進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化，參數(shù)都是 scf=(maxcycle=9999,conver=6)，為什么不同的初始距離最終優(yōu)化結(jié)果坐標(biāo)只有小數(shù)點(diǎn)前三位相同而后面不同�。渴鞘裁丛虬。烤龋吭趺锤年P(guān)鍵詞 |
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個(gè)人觀點(diǎn)，僅作參考： 坐標(biāo)差這么點(diǎn)關(guān)系不大啊，畢竟初始結(jié)構(gòu)不一樣。而且光看坐標(biāo)沒(méi)有可比性的吧，看鍵長(zhǎng)鍵角、能量等來(lái)比較是不是比較好？ 另外maxcycle需要9999么？不是說(shuō)500以上就無(wú)意義了么。。。。 |
2樓2013-11-28 11:25:42
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| 最近投了一篇稿子，是碘化學(xué)方面的合成，用DFT 3-21G基組（conver=6）對(duì)合成機(jī)理進(jìn)行了模擬解釋，兩個(gè)審稿人，一個(gè)正面評(píng)價(jià)，一個(gè)負(fù)面的批了很多，說(shuō)不相信我的實(shí)驗(yàn)結(jié)果(I do not think...)，特別是他用該方法重復(fù)了文中簡(jiǎn)單的I2的優(yōu)化說(shuō)得到不到我提供的優(yōu)化的坐標(biāo)值，事實(shí)上我們用GaussView構(gòu)建不同的初始結(jié)構(gòu)，最后優(yōu)化得到的結(jié)構(gòu)坐標(biāo)允許小數(shù)點(diǎn)后第四位開始有偏差，但我從conver=6與conver=8優(yōu)化能量值比較而言，但是這些最終的優(yōu)化結(jié)構(gòu)的能量是幾乎完全一致的（小數(shù)點(diǎn)后7位小數(shù)一致，僅第8位小數(shù)不同），當(dāng)然不排除有更精確的基組能將任意的初始構(gòu)型優(yōu)化后得到的坐標(biāo)完全一致。 |
7樓2013-11-28 21:02:56
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8樓2013-11-28 23:39:42
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9樓2013-11-29 09:22:58
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