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dingxiao7f新蟲 (初入文壇)
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[求助]
求助關(guān)于將測序的RAWDATA按樣本和V區(qū)分開
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| 如題，這次測了一批數(shù)據(jù)，情況是這樣的，有兩個樣本。測的都是16S的序列，但是每個樣本分別測了V3 V4 V6區(qū)，目的是對V區(qū)和不同樣本的的選擇比較，但是問題來了，測序公司只是給了RAWDATA，問他們要每個樣本和V區(qū)分開的數(shù)據(jù)，他們說分部開，只給我接頭的序列和V區(qū)引物的序列，想求助各位如何將混在一起的測序數(shù)據(jù)按照樣本和V區(qū)分開，數(shù)據(jù)情況是這樣的，一共是97W條READS是PAIR END測序，還有接頭的序列里有GCACTCAAYTGGGYDTAAAGNG的情況，里面有Y。N的話我還能理解，這個Y是代表什么意思，求助，謝謝 |
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