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gibbs程序計(jì)算熱力學(xué)性質(zhì)的具體用法 已有1人參與
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gibbs程序windows版在算熱力學(xué)性質(zhì)時(shí)，命令窗口應(yīng)該輸入一些什么指令？ 按照英文用戶說(shuō)明書(shū)準(zhǔn)備好的EV文件test01如下，輸入readEVdata（test01）等沒(méi)有反應(yīng)， test01.dat： # volume ang^3 # energy ry # nelectrons 2 # z 4 31.5176 -14.5664202 32.4533 -14.5804702 33.4073 -14.5938196 34.3799 -14.6065011 35.3711 -14.6185620 36.3812 -14.6300054 37.4103 -14.6408790 對(duì)程序運(yùn)行、編譯知識(shí)很匱乏，英文說(shuō)明書(shū)看的聽(tīng)糊涂，我想問(wèn)下我哪里出錯(cuò)了，該怎么做？ |
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【答案】應(yīng)助回帖
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happy小海: 金幣+2, ★★★很有幫助 2013-12-06 15:47:45
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首先，本軟件基于Quasi-Harmonic Debye模型，與聲子譜計(jì)算后的QHA模型起源于相同的公式。這是由于在統(tǒng)計(jì)熱力學(xué)中，零點(diǎn)和振動(dòng)自由能只能被定義為聲子在FBZ內(nèi)的積分。 其次，本軟件使用其他第一性原理計(jì)算得到的E-V曲線和彈性泊松比來(lái)擬合EOS并且進(jìn)一步擬合熱力學(xué)性能。具體的是把聲子與聲速進(jìn)行關(guān)聯(lián)，分類成縱/橫兩種聲速，然后縱/橫聲速又對(duì)應(yīng)了彈性常數(shù)C11和C12（僅限各向同性材料，其只有兩個(gè)相互獨(dú)立的彈性常數(shù)C11和C12），從而完成了聲子的積分。 第三，本軟件計(jì)算效率非常高，無(wú)論多么大的體系，只要有E-V曲線，有泊松比，就可以在一秒內(nèi)得到想要的熱力學(xué)結(jié)果，不占空間不占時(shí)間。 第四，2004年左右發(fā)布的Gibbs程序使用Fortran 90寫(xiě)成，本此發(fā)行的使用bash腳本，不需要進(jìn)行編譯。具體的使用方法可參考Doc中的用戶手冊(cè)。 Gibbs第一版的發(fā)布文獻(xiàn)：M.A.Blanco, E.Francisco, and V.Luana, Comput. Phys. Commu. 158, 57 (2004) Gibbs第二版的發(fā)布文獻(xiàn)：A.Otero-de-la-Roza and V. Luana, Comput. Phys. Commu. 182, 1708-1720 (2011) A.Otero-de-la-Roza and V. Luana, Comput. Phys. Commu. 182, 2232-2248 (2011) 文獻(xiàn)和軟件都附加在了附件中。 順便提一下個(gè)人的觀點(diǎn)，不見(jiàn)得正確，還希望有大牛來(lái)補(bǔ)充和說(shuō)明：Debye模型提出的時(shí)間是非常早的，至少是在能夠計(jì)算完整聲子譜之前就已經(jīng)存在的，不知道最早是怎么使用的，但是比較早的計(jì)算方面的應(yīng)用，可以回溯到1988年，由紐約IBM工作的Moruzzi和Janak及維也納科技大學(xué)的Schwarz發(fā)表在Phys Rev B, Volume 37, Number 2的論文Calculated thermal Properties of Metals。不知道是否是注意到了Debye模型中對(duì)彈性常數(shù)的各向同性近似，作者只在文章中計(jì)算了與各向同性最相近的立方結(jié)構(gòu)的金屬單質(zhì)（立方體系中有三個(gè)相互獨(dú)立的彈性常數(shù)C11，C12和C44）。后來(lái)在聲子色散譜的計(jì)算大量普及之前，也有不少人結(jié)合LMTO、LCAO等計(jì)算方法，配合Debye模型計(jì)算熱力學(xué)性能的。至于現(xiàn)在，基本主流都是使用聲子色散譜+QHA的方法了，在Quantum-ESPRESSO中，甚至給出了三階非諧波的計(jì)算（d3.x）。 另外，由于忽略了聲子的計(jì)算，也就同時(shí)忽略了動(dòng)力學(xué)穩(wěn)定性的檢驗(yàn)，比如虛頻的問(wèn)題。從原始公式可以知道，吉布斯函數(shù)中的零點(diǎn)能和振動(dòng)自由能是需要對(duì)聲子進(jìn)行積分的，而虛頻的存在則會(huì)讓公式失去計(jì)算意義。但是Debye模型則可以“overcome”這個(gè)問(wèn)題，在我個(gè)人看來(lái)，這就好像比較ln(-5)和ln(-2)的大小，使用ln(a)=0.5*2ln(a)=0.5*ln(a^2)然后得到ln(-5)>ln(-2)一樣不靠譜～ 至于E-V的取值，由于EOS對(duì)參數(shù)非常敏感，所以取值的密度和廣度都對(duì)最終結(jié)果有著非常巨大的影響，如果是為了擬合已有的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)或者QHA計(jì)算數(shù)據(jù)，還是比較容易多快好省的做到的。作者使用自己的Gibbs2，在Phys. Rev. B, 84, 024109 (2011)上也發(fā)表了一篇文章。不過(guò)從我個(gè)人觀察的來(lái)看，除非原創(chuàng)性的，否則比較少見(jiàn)使用該方法的高水平文章。 總之，這樣的方法總的來(lái)說(shuō)還是比較考驗(yàn)人的～當(dāng)然，如果作為對(duì)實(shí)驗(yàn)的粗略預(yù)測(cè)，還是有不錯(cuò)的應(yīng)用的。 最后一說(shuō)的是，Debye模型一般不被計(jì)算領(lǐng)域的人承認(rèn)為第一性原理方法的。 再補(bǔ)充個(gè)第一版的Gibbs，這樣就從擬合到計(jì)算齊活了~ 為照顧部分Windows用戶，特此推出編譯好的Windows版Gibbs v1.0程序，但是僅限于64-bit的Windows用戶使用。 |
2樓2013-12-01 21:59:02
souledge
專家顧問(wèn) (著名寫(xiě)手)
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專家經(jīng)驗(yàn): +174 - 1ST強(qiáng)帖: 19
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LS的抄得真爽……這不是我寫(xiě)的原文么…… 3樓2013-12-01 22:57:54
4樓2013-12-02 20:16:37
5樓2013-12-02 20:17:50
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哼 |
6樓2013-12-11 18:00:36
7樓2014-12-22 17:47:34
hhq_nole
新蟲(chóng) (初入文壇)
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- 專業(yè): 金屬結(jié)構(gòu)材料
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你好，可以大致說(shuō)說(shuō)cmd運(yùn)行g(shù)ibbs的方法么，或者告知一下該搜些什么關(guān)鍵字，輸入文件差不多明白了，但試了好久也不知道怎么打開(kāi)gibbs，麻煩你了。 發(fā)自小木蟲(chóng)IOS客戶端 |
8樓2017-11-30 19:26:39
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