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趙奇一新蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
運(yùn)用Gaussian時(shí)出現(xiàn)的問(wèn)題急需解答
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初學(xué)Gaussian遇到如下問(wèn)題,希望大神給予解答: 1.優(yōu)化團(tuán)簇結(jié)構(gòu)時(shí)產(chǎn)生.out文件和.chk兩種格式文件,結(jié)果發(fā)現(xiàn)這兩個(gè)文件顯示的構(gòu)型并不相同,請(qǐng)問(wèn)哪個(gè)才是優(yōu)化后得到的構(gòu)型? 2.計(jì)算電子光譜,有的人說(shuō)用"tddft",為什么這個(gè)關(guān)鍵詞是錯(cuò)誤的,而"td"是正確的?"td"和"tddft"是一回事? |
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趙奇一
新蟲(chóng) (小有名氣)
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4樓2013-12-08 11:12:29
hairan
木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
瞌睡木蟲(chóng)
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
趙奇一: 金幣+10 2013-12-08 11:09:56
gmy1990: 金幣+3 2013-12-08 19:00:54
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趙奇一: 金幣+10 2013-12-08 11:09:56
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1、out和chk文件顯示的都是優(yōu)化后的結(jié)構(gòu)。 我猜測(cè)，你所謂的不同應(yīng)該是使用GaussView打開(kāi)后，發(fā)現(xiàn)原子之間的連接情況不一樣（比如是否成鍵，成幾重鍵）。 這個(gè)主要是由于GaussView對(duì)out和chk文件的不同處理方式造成的。 對(duì)于out文件，GaussView不會(huì)考慮你輸入文件中定義的原子之間的連接方式，而是按照軟件默認(rèn)的設(shè)定根據(jù)原子之間的距離來(lái)顯示原子之間的成鍵情況。由于軟件的設(shè)置不是一定正確，此時(shí)的顯示也不一定全部正確。比方說(shuō)軟件定義C-C成鍵的最大距離是1.64，大于此數(shù)值就不顯示成鍵，你能說(shuō)1.65與1.64的C-C鍵有什么區(qū)別嗎？ 對(duì)于chk文件，由于文件中保存了你在輸入文件中定義的連接方式，GaussView在顯示時(shí)會(huì)按照你的定義來(lái)顯示而不管優(yōu)化完了原來(lái)的連接方式是否正確。 2、在Gaussian軟件中，TD是一個(gè)單獨(dú)的關(guān)鍵詞，而DFT只是一個(gè)學(xué)術(shù)的詞，在Gaussian軟件中并不存在這樣的關(guān)鍵詞，你用DFT做計(jì)算需要給出所用的具體泛函。TD可以和任何一個(gè)泛函組合，但在輸入文件的書(shū)寫(xiě)中，二者需要分開(kāi)寫(xiě)：td是一個(gè)，泛函是一個(gè)。 |
2樓2013-12-08 09:59:52
fubest
鐵桿木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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3樓2013-12-08 10:05:17
槍下游魂
木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
gmy1990: 金幣+3 2013-12-08 19:01:04
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gmy1990: 金幣+3 2013-12-08 19:01:04
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1、如果正常結(jié)束，out和chk文件都可信，可根據(jù)不同的需要看不同的文件，比如能量等看out，分子軌道等看chk 2、TD和DFT是完全不同的概念，建議LZ先搞清楚什么是DFT,高斯是如何輸入DFT的，什么是TD，你就知道為什么tddft在guassian不是一個(gè)關(guān)鍵詞了 3、激發(fā)態(tài)級(jí)數(shù)可以自己設(shè)置，查閱高斯手冊(cè)或論壇舊帖。 |
5樓2013-12-08 11:25:23
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