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369538425金蟲 (小有名氣)
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[求助]
如何制作heatmap圖
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我做了生物芯片（小鼠）處理組3張芯片還有對照組3張芯片，現(xiàn)在要寫文章做heatmap圖。但是遇到了問題，向大家求助。（mRNA和microRNA, treeview和cluster作圖） 關(guān)于做heatmap中的數(shù)值問題我不明白是表達(dá)值還是比值。如何來確定是上調(diào)還是下調(diào)？ 如果是表達(dá)值得的話，那比照什么值來看高表達(dá)和低表達(dá)啊？比如說，A基因 control值：180, 處理值：50。而B基因control值490；處理值2000.這種情況下哪個算高表達(dá)，哪個算低表達(dá)啊。（PS，我之前把表達(dá)值導(dǎo)出cluster,treeview, 一片紅啊~~） 如果是比值的話，是跟誰比啊，要是處理跟對照比，那我這就沒有文獻(xiàn)中的那種處理組和對照組了。 還是說表達(dá)值的數(shù)據(jù)需要怎么處理一下才能得到這種效果。 求大神指點啊……急求~~跪求~~ |
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