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xiaoke413至尊木蟲 (職業(yè)作家)
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[求助]
求教radius of gyration(回轉(zhuǎn)半徑)相關(guān)的問題，謝謝各位蟲友！
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小弟知道MS可以用forcite或discover算出一個(gè)分子的radius of gyration，但是我想從MS中輸出radius of gyration 隨模擬時(shí)間變化的文件，不知道各位蟲友有什么辦法，比如pearl script編程什么的，小弟不甚感激！ [ Last edited by xiaoke413 on 2013-12-19 at 11:46 ] |
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peal肯定可以 印象中help里有peal的例子 對于做很多重復(fù)性計(jì)算很方便 不過貌似radius of gyration還不需要peal 看圖 xtd文件導(dǎo)入空白study table 運(yùn)行QSAR 有radius of gyration的計(jì)算 |
xiaoke413
2樓2013-12-20 13:53:42
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確實(shí)我也沒計(jì)算出來。。。 我是在無定型晶胞放的2個(gè)小分子。。。 提示不支持周期性結(jié)構(gòu)計(jì)算。。。。 這樣你只能用forcite計(jì)算了。。。。 把xtd導(dǎo)入table 一個(gè)個(gè)結(jié)構(gòu)復(fù)制出來計(jì)算。。。 |
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4樓2013-12-23 10:07:09
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