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P450 heme環(huán) 在加力場(chǎng)參數(shù)時(shí)候出現(xiàn)問(wèn)題 已有1人參與
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| 現(xiàn)在想對(duì)P450進(jìn)行MD后的數(shù)據(jù)取樣分析，使用amber先load heme.prep和 fromcd文件，然后loadpdb P450蛋白進(jìn)行check，為什么會(huì)amber會(huì)提示could not find angle parameter :HS-SH-FE。我將loadpdb后的pdb文件打開(kāi)，發(fā)現(xiàn)原來(lái)CYS-的硫多了一個(gè)氫。和原來(lái)和FE共價(jià)連接的那個(gè)鍵斷了 |
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2樓2013-12-29 20:06:23
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