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關(guān)于FEP自由能微擾的問(wèn)題 已有1人參與
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分子模擬中 自由能微擾 相關(guān)的書(shū) 哪里講的比較清楚一些，感覺(jué)看文獻(xiàn)看的不太明白。 [ Last edited by lifeisall on 2013-12-24 at 16:37 ] |
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FEP公式本身很簡(jiǎn)單，如果你連公式都理解不了還是先去補(bǔ)一下統(tǒng)計(jì)力學(xué)基礎(chǔ)吧。 FEP的公式雖然是正確的，但運(yùn)用起來(lái)涉及采樣的問(wèn)題，也就是說(shuō)\delta U在reference system和perturbed system里面的概率分布沒(méi)有足夠的重疊的話，采樣會(huì)比較差。這時(shí)得使用其他方法比如說(shuō)BAR或者分多個(gè)窗口進(jìn)行采樣。 我個(gè)人覺(jué)得文獻(xiàn)上面講得都足夠了，我當(dāng)初是看這篇文章：http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jp102971x 這篇文章不能算非常詳細(xì)，但原理已經(jīng)介紹得比較詳細(xì)了。 |
2樓2013-12-24 23:53:13
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