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如何找到DNA甲基化的位點(diǎn) 已有1人參與
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| 知道一條DNA序列,怎么知道序列中的哪些點(diǎn)是甲基化位點(diǎn)呢?有沒有什么網(wǎng)站可以知道? |
分子生化實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn)積累 |
鐵桿木蟲 (正式寫手)
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MethDB (http://www.methdb.de) DNA甲基化和環(huán)境表觀遺傳效應(yīng)的數(shù)據(jù)庫(kù),截止到2009年9月,已經(jīng)提交了20236份5mC數(shù)據(jù)和6312份甲基化譜數(shù)據(jù)。 PubMeth(http://www.pubmeth.org) PubMeth是經(jīng)過(guò)文本挖掘相關(guān)文獻(xiàn)和人工校正過(guò)的甲基化數(shù)據(jù)庫(kù),主要是癌癥領(lǐng)域的數(shù)據(jù)。 TCGA Data Portal (http://cancergenome.nih.gov/dataportal) The Cancer Genome Atlas的數(shù)據(jù)接口,可以下載癌癥基因組的各種數(shù)據(jù),包括甲基化數(shù)據(jù)。 BDPC (http://biochem.jacobs-university.de/BDPC) BDPC是在線DNA甲基化分析平臺(tái),完成初步的重亞硫酸鹽測(cè)序分析,編輯和網(wǎng)上展示甲基化數(shù)據(jù),并聚類不同樣本的甲基化數(shù)據(jù)。 |
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