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csjl銀蟲 (小有名氣)
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[求助]
關(guān)于基因組計(jì)劃的幾個(gè)簡單問題 已有1人參與
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請教各位蟲子,有幾個(gè)關(guān)于人類基因組計(jì)劃的問題一直沒搞明白。 人類基因組計(jì)劃是從幾名匿名捐獻(xiàn)者中提取的DNA進(jìn)行測序,一個(gè)人不就夠了嗎?為啥要選幾個(gè)人?幾個(gè)人的基因組是如何整合的? 參考基因組是如何確定?如何處理多個(gè)人之間的差異? 另外,refseq是如何確定的?哪些基因可以進(jìn)入refseq數(shù)據(jù)庫? |
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幾個(gè)人,我還真沒聽說過。 一方面是重復(fù),提高數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性(降噪)。另一方面,多樣本,可以提高組裝結(jié)果的準(zhǔn)確性呀。(個(gè)人理解) 測序不用參考基因組。對于新物種都是從頭組裝。 例如SOAPdenovo軟件就是干這事的。 并不是所有的測序數(shù)據(jù),都是有效的。你如果測一個(gè)樣本的話,就存在個(gè)體差異的問題。 根據(jù)數(shù)據(jù)組裝情況,得到相關(guān)的數(shù)據(jù),作為我們現(xiàn)在分析人類基因用的Refseq。 |

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