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[求助]
RAxML constraint分析
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我想用SH對(duì)1，2，3，4這四個(gè)種進(jìn)行單系性檢測(cè)，之前用raxml -f a -x 12345 -p 12345 -# 100 -m GTRGAMMAI -s infile -n outfile -o A, B, C 構(gòu)建了一棵ML樹，現(xiàn)在希望得到一棵樹是將1，2，3，4這四個(gè)種強(qiáng)制作為單系的，我做如下定義：（（1,2,3,4）5,6,7,8,9,10,11,12），存為文件costraint.txt,再運(yùn)行命令raxml -f a -x 12345 -p 12345 -g constraint.txt -# 100 -m GTRGAMMAI -s infile -n outfile -o A, B, C 但是程序提示說starting tree <s> will be ignored by rapid bootstrapping. 請(qǐng)問下我是哪兒出了問題，需要怎么改進(jìn)？ |
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zzbbyy
新蟲 (初入文壇)
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- 注冊(cè): 2017-11-09
- 專業(yè): 生物信息學(xué)
3樓2017-11-10 22:04:55
2樓2014-05-22 19:37:53
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