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心轉(zhuǎn)角新蟲 (初入文壇)
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[求助]
Warning：Building an occasional neighobr list when atoms may have moved too far 已有3人參與
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運(yùn)行過程中一直出現(xiàn) WARNING: Building an occasional neighobr list when atoms may have moved too far (../neighbor.cpp:1453) WARNING: Building an occasional neighobr list when atoms may have moved too far (../neighbor.cpp:1453) manual解釋是This can cause LAMMPS to crash when the neighbor list is built. The solution is to check for building the regular neighbor lists more frequently。 我把neighbor 2.0 bin中2.0試著改了好多次，減小或者增大，但是都會(huì)出現(xiàn)一樣的 警告WARNING: Building an occasional neighobr list when atoms may have moved too far (../neighbor.cpp:1453) 或者錯(cuò)誤：原子丟失。 我到底該怎么修改，修改什么東西。 求大俠指點(diǎn) |
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xy515258
鐵蟲 (初入文壇)
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【答案】應(yīng)助回帖
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| 不知道是再哪個(gè)過程lost atom了？ 是一開始建盒子和原子就丟了？還是有了操作開始才丟？我也經(jīng)常丟原子。 但是一般是后者。 通過縮小步長或者修改Tdamp之類的參數(shù)可以解決。 感覺步長縮小永遠(yuǎn)是管用的。 如果是一開始就丟了。 我覺得是不是創(chuàng)建原子時(shí)候問題？ 還有。 lammps給出的解釋是要你生成neighbor列表更頻繁點(diǎn)。 而你修改bin前面的數(shù)字改的是距離啊。 當(dāng)然不會(huì)有用。 試試neigh-modify修改時(shí)間間隔？ 同新手。 只能給你這么多意見了。 |
4樓2014-03-24 18:50:30
心轉(zhuǎn)角
新蟲 (初入文壇)
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2樓2014-01-17 15:48:17
【答案】應(yīng)助回帖
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| 關(guān)于atom loss的問題我也碰到過，起初我以為是我的simulation box設(shè)置問題，后來我按照LOG文件的一個(gè)WARNING修改了pair_style不匹配問題以后，atom loss 問題也解決了，整個(gè)IN文件得以順利計(jì)算下去。樓主不妨看看系統(tǒng)有沒有出現(xiàn)類似的提示。 |
3樓2014-03-22 10:37:38
5樓2014-12-08 11:06:20
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