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dinghong1983新蟲 (初入文壇)
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[求助]
blastx和blastn結(jié)果不一致，如何確定預(yù)測結(jié)果 已有1人參與
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| 麻煩問一下我有一個序列在ncbi中blastx沒有相似序列，blastn有相似序列，翻譯的蛋白進行蛋白比對也有相似蛋白，這三個比較結(jié)果不一致，應(yīng)該哪種方法比較可信？ |
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sun_in_night
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【答案】應(yīng)助回帖
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dinghong1983: 金幣+15, ★★★很有幫助 2014-01-18 20:05:45
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做蛋白一般就直接比蛋白序列，所得結(jié)果你也得看e-vale， identity，和query然后再決定這個結(jié)果可信否。而且有些蛋白序列比較之間相似很低，但是都有相同的保守序列或保守功能結(jié)構(gòu)，這個也很可能是同一家族的蛋白。 你比核酸序列除非你在需要在核酸層面上做些什么�？偟膩碚f還是看你的目的而定。 |
2樓2014-01-18 06:39:52
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