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huzi2359金蟲 (著名寫手)
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[求助]
石墨烯在0K下的弛豫 已有2人參與
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in文件如下： units metal dimension 3 boundary p p p newton on atom_style atomic neighbor 2.0 nsq neigh_modify delay 0 every 10 read_data graphite.data mass 1 12.0108 pair_style airebo 2 1 0 pair_coeff * * CH.airebo C timestep 0.001 thermo 100 min_style cg minimize 1.0e-12 1.0e-12 1000 1000 velocity all create 0.01 4928459 mom yes rot yes dist gaussian fix 1 all npt temp 0.01 0.01 2.0 iso 0.0 0.0 20.0 compute 101 all pe/atom compute 102 all ke/atom dump 1 all custom 5000 graphite.lammpstrj id type x y z c_101 c_102 run 100000 計算時，出現(xiàn)下面這情況，麻煩幫忙看看！ MU`FANGTJ9V6NB@WHS7}O3J.jpg |
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huzi2359: 金幣+10, ★★★很有幫助 2014-01-23 20:41:55
月只藍(lán): 金幣+5, 感謝指導(dǎo) 2014-01-23 23:45:25
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幾種可能： 1. 你的原子太密集了，一個原子有太多的相鄰原子。這里看不出來，因為你的模型是READ進(jìn)去的。 2. neighbor 里面的 SKIN 設(shè)置太大了，太多原子被認(rèn)為是鄰居原子造成溢出， 那個2.0改小一點。 3. 如果這是算了幾步才出現(xiàn)的話，證明幾步以后原子都堆到一塊去了，造成溢出 建議:1. 看一下你的模型，有沒有原子重疊的情況或者原子距離很近 2. 改小2.0 3. 馳豫前不一定要能量最小化的，把CG最小化去掉，看看NPT里面能不能跑。 如果改小了2.0， 去掉最小化，第一步就出錯就是你的模型有問題，跑了幾步出錯就是你的勢有問題 |
2樓2014-01-23 20:16:28
chenkunkun
銅蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 14 (小學(xué)生)
- 金幣: 269.6
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- 性別: GG
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)
3樓2014-01-25 19:10:12
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