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quantumzx木蟲 (初入文壇)
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[求助]
Gromacs 如何選出基團(tuán)附近特定范圍內(nèi)的分子 已有1人參與
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我做了一個(gè)DNA分子在水溶液中的MD simulation, 并從 .trr 文件生成了每隔幾ps 的構(gòu)型輸出到了 .pdb文件 現(xiàn)在我需要把一個(gè)堿基和周圍特定半徑內(nèi)的水分子選出來做QM計(jì)算， 請(qǐng)問如何從 .pdb file 中找到這些水分子？ 謝謝! |
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2樓2014-01-28 11:13:03
quantumzx
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3樓2014-01-29 01:13:01
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4樓2014-01-29 06:18:34
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5樓2014-01-29 07:55:57
quantumzx
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