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秋風(fēng)2009銅蟲 (初入文壇)
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求解惑,利用MS能模擬分子量幾千萬的高分子聚合物嗎? 已有4人參與
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| 求解惑,利用MS能模擬分子量幾千萬的高分子聚合物嗎?如果只取聚合物幾個節(jié)數(shù)來模擬,模擬結(jié)果與實際是否會相差很大?這個問題一直困擾著我,求解惑,謝謝! |
木蟲 (小有名氣)

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銅蟲 (初入文壇)
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專家顧問 (正式寫手)
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高分子體系不適合用all-atom MD模擬,不光是計算量的問題,主要是因為高分子體系的勢能面非常復(fù)雜,local minimum (就是小坑)非常多,如果不升溫的話估計體系就掉在某個亞穩(wěn)態(tài)里出不來了。甚至對于有些高分子體系來說勢能面上沒有一個最穩(wěn)定的狀態(tài),只有若干個能量差不多亞穩(wěn)態(tài),做MD根本得不到最穩(wěn)定構(gòu)象。 但是可以用DPD來模擬高分子的一些性質(zhì),這個取決于你DPD的力場,Martini是目前用得比較多得。其他研究高分子體系的結(jié)構(gòu)包括DFT(所謂流體密度泛函是也)和SCFT,這方面我不太了解。 對于只有幾個單鏈的低聚物可以用all-atom MD,算算rdf什么的也沒問題。但要把你低聚物得到的性質(zhì)推廣到高聚物,這個就不太好說了,具體看你需要得到什么性質(zhì)吧。 |
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