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churchill87426木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
如何檢測(cè)短片段DNA與哪些蛋白結(jié)合？ 已有4人參與
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小弟在克隆啟動(dòng)子時(shí)發(fā)現(xiàn)某個(gè)癌細(xì)胞的啟動(dòng)子與正常細(xì)胞啟動(dòng)子相比有一段缺失，長(zhǎng)度大約是25bp。而這個(gè)啟動(dòng)子對(duì)應(yīng)的蛋白在癌細(xì)胞里面高表達(dá)。 小弟很好奇這段25bp的DNA是不是和某個(gè)蛋白結(jié)合，然后抑制了正常細(xì)胞里面該蛋白的表達(dá)；而癌細(xì)胞里面缺失這25bp，因此該蛋白高表達(dá)？ 所以小弟很想知道這25bp能和那些蛋白相互結(jié)合。求大神賜教檢測(cè)方法。 之前有朋友介紹用酵母單雜交，但由于片段比較短，不知道可行否？ 求大神們賜教，謝謝�。�！ 無(wú)論是生物信息學(xué)的方法，還是分子生物學(xué)方法都可以，謝謝了！ [ Last edited by silicare on 2014-2-17 at 15:04 ] |
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kx444555: 金幣+2, 鼓勵(lì)交流 2014-02-18 11:50:59
churchill87426: 金幣+40, 那用什么蛋白拉呢？ChIP只能知道蛋白和那些DNA結(jié)合，我怎么確定這個(gè)蛋白？ 2014-04-02 22:22:51
做染色質(zhì)免疫共沉淀（ChIP),將蛋白拉下來(lái)后，做質(zhì)譜檢測(cè) |
3樓2014-02-17 12:41:06
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