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liuchenhan新蟲 (小有名氣)
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[求助]
關(guān)于石墨加壓的lammps模擬
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小弟希望做lammps加壓下石墨晶格常數(shù)的變化。 要求：c-axis 方向加1GPa，面內(nèi)不加壓，自由變化，溫度要設(shè)在300K.以下是我的腳本。 # simulation # Initialization variable dt equal 0.0005 variable Tstart equal 1000.0 variable Tstop equal 300.0 variable Tdamp equal 100.0*${dt} variable Pstart equal 10.0 variable Pstop equal 10.0 variable Pdamp equal 1000.0*${dt} units metal dimension 3 newton on boundary p p p atom_style atomic neighbor 0.3 nsq neigh_modify check yes read_data nanonew.xyz # tersoff pair_style hybrid tersoff lj/cut 8.5 pair_coeff * * tersoff Cnew.tersoff C C C C C C C C pair_coeff 1 2 lj/cut 0.0024 3.4 #8.5 3.4 pair_coeff 1 3 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 1 4 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 1 5 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 1 6 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 1 7 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 1 8 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 2 3 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 2 4 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 2 5 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 2 6 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 2 7 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 2 8 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 3 4 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 3 5 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 3 6 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 3 7 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 3 8 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 4 5 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 4 6 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 4 7 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 4 8 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 5 6 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 5 7 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 5 8 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 6 7 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 6 8 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 7 8 lj/cut 0.0024 3.4 velocity all create ${Tstart} 1000001 mom yes rot yes dist gaussian fix NPT all npt temp ${Tstart} ${Tstop} ${Tdamp} x 10.0 10.0 1000.0*${dt} y 10.0 10.0 1000.0*${dt} z 1000.0 1000.0 1000.0*${dt} variable V equal vol variable LX equal lx variable LY equal ly variable LZ equal lz variable T equal temp variable PE equal pe variable E equal etotal fix VOL all print 100 "$V ${LX} ${LY} ${LZ}" file volume.txt screen no fix TE all print 100 "$T ${PE} $E" file TE.txt screen no run 1000000 問題：1、周期性邊界條件加的對不對，不對的話應(yīng)該怎么改; 2、壓強(qiáng)加的對不對，不對的話應(yīng)該怎么改；加壓強(qiáng)時需要周期性邊界條件嗎？ 3、腳本還有哪些錯誤的地方，麻煩指出 非常感謝大神能為小弟指點迷津，剛剛?cè)腴T，還望海涵，拜托啦。 |
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liuchenhan
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2樓2014-02-25 17:38:48
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