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jk射手座新蟲 (著名寫手)
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[求助]
用vasp腳本算極化強(qiáng)度，腳本出錯，急死了 已有1人參與
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本人在用腳本算材料的極化強(qiáng)度，腳本的編譯時這樣的： #!/bin/bash cp POSCAR1 POSCAR /public/jzh/vasp5 cp OUTCAR OUTCAR1 cp POSCAR2 POSCAR /public/jzh/vasp5 cp OUTCAR OUTCAR2 結(jié)果出現(xiàn)了錯誤，如下： /pp:line 3: 14301 Segmentation fault /public/jzh/vasp5 /pp: line 6: 14341 Segmentation fault /public/jzh/vasp5 其中，pp是我腳本的名字，然后后邊的路徑是vasp的位置，它提示說錯誤的line3 和6，就是路徑的那兩行，我很搞不懂，我一共算8個晶格參數(shù)a，3.89~3.96的 為什么3.89和3.90的可以算，后邊六個點(diǎn)死活就是算不了了呢。。。  實(shí)在不知道毛病出在哪兒了，應(yīng)該改些什么東西，求求路過的大神指教啊 |
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valenhou001
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
fzx2008: 金幣+3, 謝謝指導(dǎo) 2014-03-04 23:06:54
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fzx2008: 金幣+3, 謝謝指導(dǎo) 2014-03-04 23:06:54
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不是你的腳本出錯。提示信息“14301 Segmentation fault /public/jzh/vasp5”表明你的vasp模塊有問題，出現(xiàn)最了典型的segmentation fault錯誤�？赡苣愕挠�(jì)算體系比較大，或者是你的vasp5編譯的有點(diǎn)問題。 用一個小體系來測試看你的vasp5模塊能正常運(yùn)行，對小體系都不能正常運(yùn)行的話，那你需要在Makefile文件里設(shè)置合適的編譯選擇，重新編譯一下。 |
2樓2014-03-04 20:12:28
jk射手座
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送紅花一朵
 一語點(diǎn)醒夢中人吶！非常感謝侯老師��！我現(xiàn)在算的這個應(yīng)該就算大體系了，是PbTiO3/KTaO3超晶格材料，先前算的比例是1:1,1:2 和2:1的，也就是三層超晶格，那時候還沒有提醒，到了這個2:2的四層，以及之前也算過的4:1五層的，都會有如下提示： “ADVICE TO THIS USER RUNNING 'VASP/VAMP' (HEAR YOUR MASTER'S VOICE ...): | | | | You have a (more or less) 'large supercell' and for larger cells | | it might be more efficient to use real space projection opertators | | So try LREAL= Auto in the INCAR file. | | Mind: At the moment your POTCAR file does not contain real space | | projectors, and has to be modified, BUT if you | | want to do an extremely accurate calculation you might also keep the | | reciprocal projection scheme (i.e. LREAL=.FALSE.) ” 這里我就兩個沒明白，一個是那個LREAL我設(shè)置過，但是反而算不了了，不知道這個參數(shù)設(shè)置的時候還有其他注意的什么事項(xiàng)；第二是它說我的 POTCAR file does not contain real space ，這個是要我換掉POTCAR的類型嗎？ 當(dāng)然，如果說編譯確實(shí)出了問題，那很多問題估計(jì)也是因?yàn)榫幾g引起的，我用的vasp是通過SSH鏈接學(xué)院的服務(wù)器進(jìn)行計(jì)算的，是上上屆的師兄編譯的，具體我也不知道他怎么編譯的，總之看來要麻煩一些了 |
3樓2014-03-05 08:37:16
valenhou001
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4樓2014-03-05 08:51:56
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5樓2014-03-05 09:06:18
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6樓2014-03-05 09:55:33
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7樓2014-03-05 10:53:27
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