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luckboylys銀蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
Amber中NVT、NPT、NVE中的參數(shù)設(shè)置問(wèn)題
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首先請(qǐng)?jiān)试S我小白不懂事。。。 NVT即Canonical Ensemble，在in文件里是不是ntb = 1，tempi = temp0 NPT即Isobaric-Isothermal Ensemble，在in文件是不是ntb = 2 NVE即Microcanonical Ensemble，在in文件是不是ntt = 0， 假如不是，那么NVT、NPT的in文件該如何設(shè)置？ 文獻(xiàn)中有這樣一句話(huà)“equilibrated for 50 ps at 300 K using the NVT ensemble”該平衡指的是density.in還是equil.in呢？ 再問(wèn)，density最終目的是密度平衡，那equil呢？ 謝謝！ |
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